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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001657`

染色体: Chr01 坐标: 30639834-30641550 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001657`
名称	SmilChr01G001657
描述	uncharacterized SmilChr01G001657
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30639834 - 30641550 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006143`
GeneID	`131006143`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006143`
原始查询	`SmilChr01G001657`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=31; qcov=0.761; evalue=3.5e-26; confidence=low
Rice	`Os01g0967700` - identity=32; qcov=0.508; evalue=2.28e-14; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006143

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057789298.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057789298.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057789298.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057789298.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789298.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30639855`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,C46
`Chr1:30639861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B35,B76
`Chr1:30639862`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	96	A1,A10,A11,A18,A22,A3,A4,A8,B100,B103,B104,B106,B107,B11,B110,B112,B113,B117,B12,B121,B122,B124,B125,B131,B132,B136,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B19,B21,B23,B24,B25,B27,B29,B34,B41,B44,B48,B52,B53,B56,B57,B59,B62,B73,B81,B83,B85,B88,B89,B9,B93,B96,B97,B98,C1,C10,C11,C12,C17,C2,C20,C24,C29,C3,C30,C31,C32,C4,C41,C44,C45,C46,C48,C51,C52,C53,C58,C6,C65,C66,C68,C69,C76,C78,C80,C86,D3,D4,D8,D9
`Chr1:30639866`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	75	A1,A10,A18,A3,A4,A8,B100,B103,B104,B106,B107,B11,B110,B112,B121,B122,B124,B125,B131,B139,B14,B140,B15,B17,B19,B23,B24,B27,B34,B48,B52,B53,B56,B57,B59,B62,B73,B81,B83,B88,B89,B9,B96,B97,B98,C1,C10,C11,C12,C17,C2,C20,C29,C30,C31,C32,C4,C41,C44,C45,C46,C48,C51,C52,C6,C65,C66,C68,C69,C76,C78,C80,D4,D8,D9
`Chr1:30639880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	28	A2,A21,A4,B106,B107,B120,B133,B14,B28,B37,B38,B39,B49,B55,B63,B68,B82,B83,B91,B94,B95,C18,C34,C42,C54,C65,C76,C85
`Chr1:30639881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	93	A13,A14,A24,A6,A8,B100,B103,B110,B115,B117,B119,B12,B121,B122,B125,B129,B134,B136,B138,B15,B17,B20,B24,B27,B28,B32,B33,B34,B35,B36,B38,B41,B44,B45,B47,B5,B50,B51,B56,B6,B66,B70,B73,B78,B79,B81,B83,B84,B90,B92,B96,C10,C11,C12,C16,C20,C22,C24,C28,C36,C40,C44,C45,C47,C48,C52,C53,C54,C56,C57,C59,C6,C62,C63,C64,C66,C67,C69,C70,C72,C74,C75,C76,C77,C79,C8,C81,C87,C9,D2,D4,D5,D6
`Chr1:30639887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:30639898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr1:30639902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr1:30639948`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:30639955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr1:30639973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789298.1

301 aa

150

301

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 24-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789298.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	24	113	1.2e-18	68.2	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933315.1
ATGGGTATTCCTCTCTGCCCGGCTCCTGAACTCGATAGGCCGATCTGGCACTTCTCTCCTCACGGGCGCTATACGGTGAAGTCCGCATATAAAATGGCGAGCGCTCTCACCCTCGACCTCAGCTACGGAGAGGAGGGCTCCTGGATACATATATGGAAAATTCCTGTGCTGCCTAAGGTGAAGTCCTTCCTTTGGAGAGCTGTTAAGAACAACCTCCCCTCTAAGGAGAATCTTTTATCGCGAGGGATTCTAGTTGGAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006143
ATGGGTATTCCTCTCTGCCCGGCTCCTGAACTCGATAGGCCGATCTGGCACTTCTCTCCTCACGGGCGCTATACGGTGAAGTCCGCATATAAAATGGCGAGCGCTCTCACCCTCGACCTCAGCTACGGAGAGGAGGGCTCCTGGATACATATATGGAAAATTCCTGTGCTGCCTAAGGTGAAGTCCTTCCTTTGGAGAGCTGTTAAGAACAACCTCCCCTCTAAGGAGAATCTTTTATCGCGAGGGATTCTAGTTGGAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789298.1
MGIPLCPAPELDRPIWHFSPHGRYTVKSAYKMASALTLDLSYGEEGSWIHIWKIPVLPKVKSFLWRAVKNNLPSKENLLSRGILVGGECGTCKMGYENLWHVFFACPFAEECWRIGGLSTLLGSLRDRSDSFKEALSTLLSSDVGASAAKVSMILWHVRKDRNKAVWEGAIPNPSRTVTLAASCREDWLLAQAASSLPSSTVAVVSSQDPCVGWHNLQEGWVYVVWMPFFSQVMALWELSMKVPGRRGVDEGELMGIKEA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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