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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001658`

染色体: Chr01 坐标: 30648328-30650655 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001658`
名称	SmilChr01G001658
描述	growth-regulating factor 2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30648328 - 30650655 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019729`
GeneID	`131019729`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019729`
原始查询	`SmilChr01G001658`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	growth-regulating factor 2-like
产物	growth-regulating factor 2-like
Arabidopsis	`AT4G37740` (GRF2) growth-regulating factor 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829930] identity=31.1; qcov=0.748; evalue=3.78e-37; confidence=low
Rice	`Os02g0701300` (GS2) - identity=56.8; qcov=0.219; evalue=9.06e-38; confidence=weak
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006351 (DNA-templated transcription); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0032502 (developmental process)
KEGG	-
Pfam	PF08879 (WRC); PF08880 (QLQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019729

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804304.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804304.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804304.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804304.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057804304.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30648808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr1:30648830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C71
`Chr1:30648866`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B9
`Chr1:30648874`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr1:30649257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:30649433`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr1:30649463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr1:30649550`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A23,B99,C14,C35,C73,C80,C84
`Chr1:30649694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:30649938`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:30650070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr1:30650333`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B139,C43

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804304.1

507 aa

254

507

QLQ

WRC

PF08880 QLQ 134-166 aa PF08879 WRC 193-235 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804304.1`	Pfam	`PF08880`	QLQ	Domain	134	166	2.1e-13	50.4	QLQ
`XP_057804304.1`	Pfam	`PF08879`	WRC	Domain	193	235	4.9e-20	71.7	WRC

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948321.1
ATACTCCAACGGTGAGAATGTCGGAAGCACGGAAGCAAAACAATGGCGGCAAAGCTATTACTAAATTCCAGGCTTGAGCCCCCACACCCCATCCCTCATAAAATCAAAATCCCACTCCTGTCTCTTCGCACAAATCCCATTACATAAATCATCATAAACCTATAAAAACCTTTGAATTTCTTCATAACACACACATAGGTAACACTTTTCTGGAGCCTCATAATCGCTTCCACAAATTTCCCTTTTTCTTTATTTTAGGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019729
ATGAGTGGTTTGGAAAAAGCAGCTAAACAAAATAGGGATTCTAGCATCTCGCAAAACAAATCATCATCTGGCGATGATGTAGTTCGATTGAAGAGGATGATGGGCTCTCACCCGCGAGAGATTAATCTGTTTGATAGAGGCGGTGGCAGAGGAGTCGGTGGTGGAGGAGGTGGTGGTGGTGGTGGGCCCAACAGCTGTAATAGCGGCGGAGCTACCGAGGCGGTGGGCCATGCGTACGGTGATGATGTCTCATCATCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804304.1
MSGLEKAAKQNRDSSISQNKSSSGDDVVRLKRMMGSHPREINLFDRGGGRGVGGGGGGGGGGPNSCNSGGATEAVGHAYGDDVSSSSRLGGENFATSGTTNSQSFDIFAAAAYSATPYKSPEEMAAAAAAAAFPFTFAQWKELERQAMIYKYMISSVPVPPDLLFPHSRNFSAAPLDYPASLYNARYSRNGDPEPGRCKRTDGKKWRCSRDVAPHQKYCERHLHRGRPRSRKPVEVKNNAENLKKTRTEQSNVPSSTTVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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