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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001660`

染色体: Chr01 坐标: 30679910-30681224 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001660`
名称	SmilChr01G001660
描述	small heat shock protein, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30679910 - 30681224 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019746`
GeneID	`131019746`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019746`
原始查询	`SmilChr01G001660`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	small heat shock protein, chloroplastic-like
产物	small heat shock protein%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G27670` (HSP21) heat shock protein 21 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828881] identity=51.5; qcov=1.05; evalue=7.95e-67; confidence=high
Rice	`Os03g0245800` (OsHSP26) - identity=49.1; qcov=1.04; evalue=2.37e-62; confidence=high
GO	GO:0009408 (response to heat)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00011 (HSP20); PF17886 (ArsA_HSP20)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019746

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057804316.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057804316.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804316.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804316.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804316.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30680306`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:30680316`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C65
`Chr1:30680514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,A9,B18,B61
`Chr1:30680523`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B3,B86,C15,C65
`Chr1:30680539`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C9
`Chr1:30680539`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C9
`Chr1:30680542`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C9
`Chr1:30680803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B119,B123,B82,C10,C66
`Chr1:30680887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B45,C56,C72
`Chr1:30680994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:30680995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:30681117`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804316.1

227 aa

114

227

HSP20

ArsA_HSP20

PF00011 HSP20 134-225 aa PF17886 ArsA_HSP20 140-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804316.1`	Pfam	`PF00011`	HSP20	Domain	134	225	1.6e-24	86.7	Hsp20/alpha crystallin family
`XP_057804316.1`	Pfam	`PF17886`	ArsA_HSP20	Domain	140	210	6.8e-06	26.3	HSP20-like domain found in ArsA

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948333.1
CATCTCTTGGCCAGAACAATTTGACTCAAAATTCGCAATAAATAAACGCTACAATTTGGGCCTCCAATTTTCAGTCAAGCCCATCAACAGGCCCTAGCCCAATCAAAAAGGCCCAACCACTTCAACGGCGCGAACACTAGATAATTCGCGAATGTAGCAGAAATATTGAGCAAAATCATGAATTTATGGAGAAATCTTGCATGAAAAATTCCGCAAGAACATTCAAGAAAACTGACGAAACACAACGATTTCGCAAGACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019746
ATGGCGACCGGAACTCTGAGTTTCTCTCCGCTTTCATCAAACAGCGTTGTTGCTACGACAAACAGAGCTGCCGTCGTTCCTTGCTCCGCATTCTTCCCTTCGGCATGTAAGCTAGCAAAAAGCAGGTCGTCGTCGTCTGTCAGAGCTCAGGCCACCGGAGATAGCAAAGACTCCGCCGTCGACGTTCATGTTACCAGCGGACAGCGCGGCGGTGATGACCAGCGCACCGCCGTCGAACGCCGCCCGCGGCGCCTGGCTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804316.1
MATGTLSFSPLSSNSVVATTNRAAVVPCSAFFPSACKLAKSRSSSSVRAQATGDSKDSAVDVHVTSGQRGGDDQRTAVERRPRRLAADVVSPFGLLDRVSPMRSMRQMLDTMDRLFGDVMTYPGTAAEARWPWDMSEEENEVRMRFDMPGLSKEDVRVCVEDDVLVIKGDRKSDDGWSSYSSYATRLRLPENFDKEKVKAEMKNGVLCISVPKTKVERKVVDVEITG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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