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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001677`

染色体: Chr01 坐标: 30962534-30963878 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001677`
名称	SmilChr01G001677
描述	probable aquaporin TIP-type
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	30962534 - 30963878 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131019910`
GeneID	`131019910`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131019910`
原始查询	`SmilChr01G001677`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable aquaporin TIP-type
产物	probable aquaporin TIP-type
Arabidopsis	`AT2G36830` (GAMMA-TIP) gamma tonoplast intrinsic protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818255] identity=69.9; qcov=0.961; evalue=4.8e-116; confidence=high
Rice	`Os03g0146100` (OsTIP1) - identity=70.2; qcov=0.957; evalue=1.22e-113; confidence=high
GO	GO:0006833 (water transport); GO:0009705 (plant-type vacuole membrane); GO:0015250 (water channel activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00230 (MIP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131019910

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057804520.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057804520.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057804520.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804520.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804520.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:30962785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr1:30962806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B130,C51
`Chr1:30962824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:30962830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A6,B137,B79,B8,D1
`Chr1:30962896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:30963330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr1:30963398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B30
`Chr1:30963422`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr1:30963524`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C61
`Chr1:30963524`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804520.1

256 aa

128

256

MIP

PF00230 MIP 23-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804520.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	23	241	1.1e-70	238.6	Major intrinsic protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948537.1
AATTATTGAGCAAAATGATTCAATCAGAGATTAAAAAAATCTGACAGTTTGACGAAAAGGGTACAATAGTCCGGTTTTTGAAGTTGGTTGATAAAATAAAATGATAGTCGGCCATAAACCATAGTTGGCAATAATGCACGGGGCCACCGGCAACCGGCTGCAGCGGTGCGTCACAGAACCCATGCAGAAAATTTCCAATATAAGAATAGTACCGCATGCACTCATCTCTCTCACTCTCACTCTCACTCCTCAATAATCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131019910
ATGCCGGGCCCCGGCGACCACTTCAACGTCCCCCTCAGCCGCGTTGCCATCGGCAACCGCGACGAGTTCAGGCAGCCCGGCGCCCTCAAGGCTGCCGTGGCTGAGTTCATCAGCACCCTCATCTTCGTCTTCGCCGGCTCCGGCGCCGGCATTGCCTACAACAACCTCACCCACGACGGCGCCGCCTCCCCCTCCGGCCTGATCTCCGCCTCCATCGCCCACGCCTTCGCCCTCTTCGTCGCCGTCGCCATCAGCGCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804520.1
MPGPGDHFNVPLSRVAIGNRDEFRQPGALKAAVAEFISTLIFVFAGSGAGIAYNNLTHDGAASPSGLISASIAHAFALFVAVAISANISGGHVNPAVTFGLFIGGNITLFRGILYIIAQLLGATAASALLIFTTGLAVPTFGVAGISVWSALVFEIVATFGLVYTVYATAVDPKKGEIGIIAPIAIGLIVGANIFAAGPFTGAAMNPAVAFGPALVGFSWANHWIYWAGPLVGAGLAGIVYEVFFISHTHEPLSEF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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