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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001692`

染色体: Chr01 坐标: 31142274-31143980 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001692`
名称	SmilChr01G001692
描述	cyclin-dependent kinases regulatory subunit 1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31142274 - 31143980 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020042`
GeneID	`131020042`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020042`
原始查询	`SmilChr01G001692`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclin-dependent kinases regulatory subunit 1
产物	cyclin-dependent kinases regulatory subunit 1
Arabidopsis	`AT2G27970` (CKS2) CDK-subunit 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817341] identity=88.8; qcov=0.976; evalue=1.5e-50; confidence=medium
Rice	`Os03g0146300` (Orysa) - identity=97.3; qcov=0.89; evalue=5.5e-50; confidence=medium
GO	GO:0000307 (cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex); GO:0007346 (regulation of mitotic cell cycle); GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0019901 (protein kinase binding); GO:0042393 (histone binding); GO:0043130 (ubiquitin binding); GO:0061575 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activator activity)
KEGG	-
Pfam	PF01111 (CKS)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020042

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057804661.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057804661.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804661.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804661.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057804661.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31142751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B114,B81,B95,C7
`Chr1:31142766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B6,C47
`Chr1:31143349`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:31143358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr1:31143501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B129,B139,B22,C37,C61

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804661.1

82 aa

CKS

PF01111 CKS 4-70 aa

XP_057804669.1

82 aa

CKS

PF01111 CKS 4-70 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804661.1`	Pfam	`PF01111`	CKS	Domain	4	70	3.9e-37	127.0	Cyclin-dependent kinase regulatory subunit
`XP_057804669.1`	Pfam	`PF01111`	CKS	Domain	4	70	3.9e-37	127.0	Cyclin-dependent kinase regulatory subunit

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948678.1
ATGTGAACGGCAACTTGGTTGGGCTCGTTGAGATGCCAATGCTACTAAAAATCAGGCCAATCATTGAGATTCATGTTCATTATTTAATTATATATAAGCGGGAATATTTCGAAATTTGAAATTCAATTGAGGGCCACAGGTTTCCTCATTTAATAAATTTCCGAAAACAACCTTTCAAGTCCTACGATAAAATTCTTTCTACTTCTCTTTTTCCTCTTCTGTGTATCATTCGTTTTTTCTTGCTCTCACTCAACTCCTCT...

XM_057948686.1
TCAATTGAGGGCCACAGGTTTCCTCATTTAATAAATTTCCGAAAACAACCTTTCAAGTCCTACGATAAAATTCTTTCTACTTCTCTTTTTCCTCTTCTGTGTATCATTCGTTTTTTCTTGCTCTCACTCAACTCCTCTCTCTCTCTTTCTCTCTCCGCGACTGCCAAGAAAATGGGGCAGATCCAGTATTCGGACAAGTATTTTGATGATACGTACGAGTACAGACATGTTGTCCTTCCACCGGAGGTTGCCAAACTGCT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020042
ATGGGGCAGATCCAGTATTCGGACAAGTATTTTGATGATACGTACGAGTACAGACATGTTGTCCTTCCACCGGAGGTTGCCAAACTGCTTCAGAAGAATCGCCTTCTCTCCGAGAATGAATGGCGCGCAATCGGGGTTCAACAGAGCCGAGGGTGGGTCCACTACGCGATCCACCGCCCAGAGCCACATATCATGCTTTTCAGGAGGCCACTGAACTTTCAGCAGCAGCAGGATAATCAAGCTCAGTAA

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057804661.1
MGQIQYSDKYFDDTYEYRHVVLPPEVAKLLQKNRLLSENEWRAIGVQQSRGWVHYAIHRPEPHIMLFRRPLNFQQQQDNQAQ

XP_057804669.1
MGQIQYSDKYFDDTYEYRHVVLPPEVAKLLQKNRLLSENEWRAIGVQQSRGWVHYAIHRPEPHIMLFRRPLNFQQQQDNQAQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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