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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001694`

染色体: Chr01 坐标: 31194075-31199123 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001694`
名称	SmilChr01G001694
描述	uncharacterized SmilChr01G001694
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31194075 - 31199123 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020067`
GeneID	`131020067`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020067`
原始查询	`SmilChr01G001694`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ring/U-Box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817339]; symbol=AT2G27950; hit=AT2G27950; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Ring/U-Box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817339]; symbol=AT2G27950; hit=AT2G27950; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G27950` (AT2G27950) Ring/U-Box superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817339] identity=38.7; qcov=1.07; evalue=1.72e-154; confidence=medium
Rice	`Os09g0570500` (OsRFPHC-16) - identity=49.1; qcov=0.353; evalue=1.4e-77; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13920 (zf-C3HC4_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020067

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057804698.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057804698.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057804698.1`
4	Endosome	内体	0.20000	`XP_057804698.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804698.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31195042`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:31195199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:31195287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr1:31195334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C1,C13,C43
`Chr1:31195446`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:31195564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D7
`Chr1:31195628`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B51,D10
`Chr1:31196051`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr1:31196065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B63
`Chr1:31196076`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr1:31196601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:31196778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804698.1

824 aa

412

824

zf-C3HC4_3

PF13920 zf-C3HC4_3 770-814 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804698.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	770	814	1.4e-11	44.8	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100596.1
CTTTTTATTTTTCTTTTTTAGCTGTTGTTTACTATTCATAACTCATAAACAAATCCCACCTCTTCTTCCTTCCCCTCTCTCTTTCTCTCTCTAGATTGTCTCCTCTGCAACTGCAACCGTTTCTTTCTCTTTTCAACTTCTTCTTCTCTCTCTCCGTACATAGATTACACGTATTGGGTGGGGAGCTGAATGTGAAGAATTGGTGTCCCATAGTATTTGCAGAGAGGCATTGTTTGATGTTTGTGTTGACTTCGAATTTC...

XM_057948715.1
AATTAGACGGTGCCGCTGACGTTGTTCTTTTTATTTTTCTTTTTTAGCTGTTGTTTACTATTCATAACTCATAAACAAATCCCACCTCTTCTTCCTTCCCCTCTCTCTTTCTCTCTCTAGATTGTCTCCTCTGCAACTGCAACCGTTTCTTTCTCTTTTCAACTTCTTCTTCTCTCTCTCCGTACATAGATTACACGTATTGGGTGGGGAGCTGAATGTGAAGAATTGGTGTCCCATAGTATTTGCAGAGAGGCATTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020067
ATGGCTGTCGCGGGTTTGCATAATCTATCTGCTTTTGGTCCCTTCTTTGGGGACTCCCAATCTACTGTGTCGAGGCAGTGGAGTGATGAAGCTGGCACGCCTCGCACCCGGGCATCCTCTCTTTTGCAGATGTGGCGAGAGCTCGAGGGTGACCATGTGGTGAGCCCTTCGCATAGGTCAAGGGGGAGGAGAATTGCCCCAAGGAGTGATAATGGGCATGATATCTCTGAAGATGCGGATGATACTGAGACTCAGGCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804698.1
MAVAGLHNLSAFGPFFGDSQSTVSRQWSDEAGTPRTRASSLLQMWRELEGDHVVSPSHRSRGRRIAPRSDNGHDISEDADDTETQAVTGSEIDHDDNNSIISEQSSDLGEVERERVRQIFQEWTNSGAMGRSPLNNRSGPQWLGENECERVRVIREWVQVNAQHRNNQASVRDGGADAGSHIEQVREGLTVAHHEAVARRPIRRLCGRQTLLDLLQRAQCERKEELQGLLEHRPVSDFTHRNRIQALLRGRFLRNERMVP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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