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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001697`

染色体: Chr01 坐标: 31258543-31262122 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001697`
名称	SmilChr01G001697
描述	uncharacterized SmilChr01G001697
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31258543 - 31262122 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020090`
GeneID	`131020090`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020090`
原始查询	`SmilChr01G001697`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os12g0156200; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G01050` (AT2G01050) zinc ion binding / nucleic acid binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814629] identity=23.4; qcov=0.934; evalue=2.62e-10; confidence=weak
Rice	`Os12g0156200` - identity=26.4; qcov=0.794; evalue=8.23e-17; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020090

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057804732.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057804732.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057804732.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804732.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804732.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31258901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A5,B129,B22,B35,B76,C37,C61,C82
`Chr1:31258916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B59,B80
`Chr1:31258964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B37,B39,B9,C2
`Chr1:31258993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B91,B94
`Chr1:31259046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C69
`Chr1:31259066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr1:31259067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B94,C67
`Chr1:31259071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr1:31259100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	C11,C63,C69
`Chr1:31259100`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C63,C69
`Chr1:31259127`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	A10,A22,B1,B101,B102,B104,B130,B14,B18,B26,B36,B37,B72,B90,B98,C15,C2,C45
`Chr1:31259130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,C11,C63,C69

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948749.1
TTTTCTCAAAAATAGGACTGTTAAATTCAGTAATTTAGAATAGTCAACATGTTTTTAGACATTGATTAGTGACAACCAATCCCTATAAGTTTAAAATAAGGGAGTACATATAAGACTTTATTAAATTTATTTAATATTTATTGATAAAATAGGGAACCAAAATTGAGGCATCGTGATTTTAAGTAGTTAGACTAAACATCTTACTCTGTGAACTCTTTCCGCGGCGCAAGGTTTTTCTTGAGAGATTAGTTTGCTTTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020090
ATGGATCCTGATGAGATTGCCAGACGTGTGGCGGATCTTCAGCTGGCCACGGAAAACTCCACTAAAATCATAAGAATGACAGCGCAAGAATCAGAATCAGAGAATAAAAAGGCGTCTACGATGCTTATTGGTAAGATCTTCGCCGATAGGCAGCACCCACGCGATCTGCTTCGCGAAAAAATTCCAGCGGTGCTCCAGATCCGGGGTTACGTTGATGTCGAAATTGTGGGTTTCAATGTCTTTGTTTTACATCTTGATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804732.1
MDPDEIARRVADLQLATENSTKIIRMTAQESESENKKASTMLIGKIFADRQHPRDLLREKIPAVLQIRGYVDVEIVGFNVFVLHLDLETDLARILTDGPWHLFNDLMVIRRPDPLKTASTTEFIDISIWIQLHNLALACMNSRMVRRIGEKVGAVMEVEEGEGGRCLGKFARARVLRSIQEPLVRCVSIEVEGNKEPMMVLVLYEKLLDNFCFACGKIGHFLKNCDASKEAKAKPSFGNWLRA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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