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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001716`

染色体: Chr01 坐标: 31635137-31638196 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001716`
名称	SmilChr01G001716
描述	protein RETICULATA-RELATED 1, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31635137 - 31638196 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020505`
GeneID	`131020505`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020505`
原始查询	`SmilChr01G001716`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein RETICULATA-RELATED 1, chloroplastic-like
产物	protein RETICULATA-RELATED 1%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G22790` (RER1) reticulata-related 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832342] identity=75.7; qcov=0.744; evalue=1.68e-165; confidence=high
Rice	`Os04g0524400` - identity=77; qcov=0.731; evalue=1.93e-163; confidence=high
GO	GO:0009706 (chloroplast inner membrane); GO:0099402 (plant organ development)
KEGG	-
Pfam	PF11891 (RETICULATA-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020505

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057805340.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	1.00000	`XP_057805340.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.20000	`XP_057805340.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805340.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805340.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31635972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:31637051`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:31637106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr1:31637569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr1:31637616`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr1:31637653`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B98,C48
`Chr1:31637889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B94,C3,C30
`Chr1:31637905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805340.1

398 aa

199

398

RETICULATA-like

PF11891 RETICULATA-like 174-352 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805340.1`	Pfam	`PF11891`	RETICULATA-like	Family	174	352	1.6e-65	220.8	Protein RETICULATA-related

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949357.1
CACGTATTTTTTTTAATTTGCTTATTATTTTTTTGGGAGGGAGTAAGTGATAAAGAATTGAGTTTTAATAGGTTGGTGCGAGGACGTGAGTTGGCATCGCACAGGATTACAGCCCTCACACTCTGAGTCCAACCTAAAGCAGCACAGTCGGCGACGCCGCTGGCGGAATTCTGCCGCAGCAGCTTCGTCTACCGATTTCTCGATTCAAACGATGTCGCTCTGTCCTCCGACCGGAGGATTTACCACTCCGAAGCTCCATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020505
ATGTCGCTCTGTCCTCCGACCGGAGGATTTACCACTCCGAAGCTCCATAGCTCACCGCACCAACCTACTTGCACAAACGTCGCTCTCAAATTTAACGTTTTTGCCAACTTTTCTCCCTCCAATCAGCCGTCGTTAAGGATCGACACGGAGAATCCATTCCAGATACAGTGCGCCGCGCCGGACGCCGCGACGGAGAAGGTTAGTCTGCCGGAGGATTTTGAGGAACCGAAACTAGACGACGGTGGCGATGGAGACGGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805340.1
MSLCPPTGGFTTPKLHSSPHQPTCTNVALKFNVFANFSPSNQPSLRIDTENPFQIQCAAPDAATEKVSLPEDFEEPKLDDGGDGDGGNGRFPLGGGGSGGEGDDGGGEDEFGPIVKYDEVLFEAESRGAVLPADMIEAAKSTGLRRLFLTRYLDLQSSAWPLGFLMRYCSMLRNRMLADPSFLFKVGTEVVIDSCCATFAEVNKRGKDFWAEFELYAADLLVGIVVDIALVGMLAPYARIGNRPISSGFRGRMQQSFAAL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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