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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001721`

染色体: Chr01 坐标: 31685263-31686471 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001721`
名称	SmilChr01G001721
描述	U3 small nucleolar RNA-associated protein 25-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31685263 - 31686471 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006315`
GeneID	`131006315`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006315`
原始查询	`SmilChr01G001721`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U3 small nucleolar RNA-associated protein 25-like
产物	U3 small nucleolar RNA-associated protein 25-like
Arabidopsis	`AT5G15685` (AT5G15685) mutator transposase MUDRA protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721163] identity=28.7; qcov=0.667; evalue=8.93e-34; confidence=low
Rice	`Os06g0704400` - identity=30.2; qcov=0.891; evalue=1.19e-44; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03108 (DBD_Tnp_Mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006315

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789503.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789503.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789503.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789503.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789503.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31685266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B8
`Chr1:31685267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C61,C82
`Chr1:31685274`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B15,B83,B89,C80
`Chr1:31685322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C72
`Chr1:31685325`	`A`	`AT`	1bp_insertion	stop_gained,frameshift_variant	10	B102,B107,B71,B93,C54,C64,C82,C9,D10,D8
`Chr1:31685336`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr1:31685371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr1:31685386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,B8
`Chr1:31685401`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	136	A10,A13,A16,A18,A20,A22,A23,A24,A5,A7,B1,B10,B100,B102,B103,B108,B11,B111,B113,B114,B117,B119,B121,B122,B123,B125,B127,B129,B130,B134,B136,B14,B140,B17,B2,B20,B22,B24,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B34,B36,B37,B38,B40,B41,B42,B44,B46,B47,B49,B5,B50,B52,B53,B54,B55,B57,B59,B61,B62,B63,B64,B67,B69,B7,B71,B73,B74,B78,B79,B8,B81,B82,B85,B86,B87,B88,B9,B91,B93,B94,B97,C18,C19,C2,C20,C22,C23,C24,C25,C29,C3,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C41,C42,C43,C44,C49,C5,C50,C54,C58,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C67,C68,C69,C72,C73,C75,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C86,C9,D10,D11,D8
`Chr1:31685404`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	131	A10,A13,A16,A18,A20,A22,A23,A24,A5,A7,B1,B10,B100,B102,B103,B108,B11,B111,B113,B114,B117,B119,B121,B122,B123,B125,B127,B129,B130,B134,B136,B14,B140,B17,B2,B20,B22,B24,B26,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B34,B36,B37,B40,B41,B42,B44,B46,B47,B49,B5,B52,B53,B54,B55,B57,B59,B61,B62,B63,B64,B67,B69,B71,B73,B78,B79,B8,B81,B82,B85,B86,B87,B88,B9,B91,B93,B94,B97,C18,C19,C2,C20,C22,C23,C24,C25,C29,C3,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C41,C42,C43,C44,C49,C5,C50,C54,C58,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C67,C68,C69,C72,C73,C78,C79,C8,C80,C82,C83,C86,C9,D10,D11,D8
`Chr1:31685411`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B35,B76,C10,C64
`Chr1:31685414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B28,C50

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789503.1

402 aa

201

402

DBD_Tnp_Mut

MULE

PF03108 DBD_Tnp_Mut 132-190 aa PF10551 MULE 331-400 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789503.1`	Pfam	`PF03108`	DBD_Tnp_Mut	Family	132	190	3.3e-10	40.2	MuDR family transposase
`XP_057789503.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	331	400	6.6e-08	33.5	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933520.1
ATGCCTAGTTTCACACCATTGAGCTTGTTTACAGAAGAAGAGCTCGATAGAGGTCTAGAGGCAGAGGATATGGGTGAGCAAAATAATGATGATGTTGTGGGTAGGAATGATGAAAGAGAAGAGGGCAGGGATGATGACAAAGATGAGGGCAGGGATAATGACAGAGATGAGGGGGTGATTAGGGATGAAGTAAGAGATGAGGCAGTTGATATGGAAGCAGAGGTGGATGAGGGTGAGAGTGAAAGAGATGAGGGCAGGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006315
ATGCCTAGTTTCACACCATTGAGCTTGTTTACAGAAGAAGAGCTCGATAGAGGTCTAGAGGCAGAGGATATGGGTGAGCAAAATAATGATGATGTTGTGGGTAGGAATGATGAAAGAGAAGAGGGCAGGGATGATGACAAAGATGAGGGCAGGGATAATGACAGAGATGAGGGGGTGATTAGGGATGAAGTAAGAGATGAGGCAGTTGATATGGAAGCAGAGGTGGATGAGGGTGAGAGTGAAAGAGATGAGGGCAGGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789503.1
MPSFTPLSLFTEEELDRGLEAEDMGEQNNDDVVGRNDEREEGRDDDKDEGRDNDRDEGVIRDEVRDEAVDMEAEVDEGESERDEGRDNDRDEGMISDDDSSVYSGHLSKSEVDEQEVEQVMVTVEDGEEGRFQLGQTFAGAKEAREAINSYGVKFGYKIKFVKNEKTRIRVVCMNEKECPFLMHVSKDGDAEGLVIKTLILEHTCCKQREVLSASQGYLAKYFKQAVCRNPKYTSKDMQGHVKDHLKLHVNLAKCKRAKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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