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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001723`

染色体: Chr01 坐标: 31774114-31774791 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001723`
名称	SmilChr01G001723
描述	uncharacterized SmilChr01G001723
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	31774114 - 31774791 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006360`
GeneID	`131006360`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006360`
原始查询	`SmilChr01G001723`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=54.7; qcov=0.471; evalue=7.57e-37; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=65.5; qcov=0.773; evalue=1.53e-85; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006360

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789536.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057789536.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789536.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789536.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789536.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:31774139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A1,B56,B86,C38
`Chr1:31774161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr1:31774176`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B54,B58,D3
`Chr1:31774405`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B20,B26,B3,B45,B67,C3,C42,C9
`Chr1:31774437`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A15,B104,B128,B133,B137,B15,B32,B36,B69,C30,C34,C45,C71,C74
`Chr1:31774443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C70
`Chr1:31774445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,B79
`Chr1:31774472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,C9
`Chr1:31774474`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B45,C9
`Chr1:31774488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A16,A9,B102,B34,B56,B7,B71,B72,B82,C20,C38,C49,C5,C68
`Chr1:31774530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A3,B121,B18,B65
`Chr1:31774549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C58,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789536.1

225 aa

112

225

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF04827 Plant_tran 32-205 aa PF13359 DDE_Tnp_4 56-196 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789536.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	32	205	1.7e-88	296.3	Plant transposon protein
`XP_057789536.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	56	196	5.6e-10	39.8	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933553.1
ATGTCTTCATCTTCTTCTGAGCGTGATGTTGAAGAAACAGCTGCATCTGCAGCTGAAGCCTTTATGGAAGAGTACACGCGCCAATACATGGAGGATGATAGTATGCACTGGACATGGAAAAATTGCCCAGTAGCATGGAAAGGCCAATTCACCCGTGGCGATCATGGAGTCCCAACAATTATGCTTGAGGCGGTTGCATCTCAAGATTTGTGGATCTGGCATGCTTTTTTTGGAGTTGCAGGGTCAAACAATGATATAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006360
ATGTCTTCATCTTCTTCTGAGCGTGATGTTGAAGAAACAGCTGCATCTGCAGCTGAAGCCTTTATGGAAGAGTACACGCGCCAATACATGGAGGATGATAGTATGCACTGGACATGGAAAAATTGCCCAGTAGCATGGAAAGGCCAATTCACCCGTGGCGATCATGGAGTCCCAACAATTATGCTTGAGGCGGTTGCATCTCAAGATTTGTGGATCTGGCATGCTTTTTTTGGAGTTGCAGGGTCAAACAATGATATAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789536.1
MSSSSSERDVEETAASAAEAFMEEYTRQYMEDDSMHWTWKNCPVAWKGQFTRGDHGVPTIMLEAVASQDLWIWHAFFGVAGSNNDINVLNQSTLFNDVLQGQAPSISFTVNDTQYAHGYYLTDGIYPEWATFVKSFQHPQDPKRRKFKEMQEAAIKDVERAFGVLQARWAMIRGPSRLWYTENITDIMYACIILHNMIIEDEGEMACQWVEDELSTSRATILQEK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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