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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001739`

染色体: Chr01 坐标: 32015658-32019570 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001739`
名称	SmilChr01G001739
描述	probable 2-carboxy-D-arabinitol-1-phosphatase
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32015658 - 32019570 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020396`
GeneID	`131020396`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020396`
原始查询	`SmilChr01G001739`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable 2-carboxy-D-arabinitol-1-phosphatase
产物	probable 2-carboxy-D-arabinitol-1-phosphatase
Arabidopsis	`AT5G22620` (AT5G22620) phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832325] identity=66.9; qcov=0.86; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0150100` - identity=66.9; qcov=0.883; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016791 (phosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00300 (His_Phos_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020396

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057805158.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	1.00000	`XP_057805158.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805158.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805158.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805158.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32015883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C45
`Chr1:32015919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr1:32016160`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr1:32016269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,B92
`Chr1:32016525`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr1:32016808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B16,B18,B57,B66
`Chr1:32017516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A20,B16,B18,B57,B66
`Chr1:32017721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B99
`Chr1:32017764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,B78
`Chr1:32017834`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B44,B67
`Chr1:32017834`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B44,B67
`Chr1:32017856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805158.1

513 aa

256

513

His_Phos_1

PF00300 His_Phos_1 79-262 aa PF00300 His_Phos_1 297-480 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805158.1`	Pfam	`PF00300`	His_Phos_1	Domain	79	262	1.4e-54	185.5	Histidine phosphatase superfamily (branch 1)
`XP_057805158.1`	Pfam	`PF00300`	His_Phos_1	Domain	297	480	1.4e-54	185.5	Histidine phosphatase superfamily (branch 1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949175.1
TTGAGTTTGGGCTTTTCATGAATAAGAGCAACGACTTAACTTAACCACCAGAAAAGAAAATAACTGTCACTGTCTTTTACCGCCAAAAACAAAGAGCAAAAAATATCAGCCTAAGAAAAAAAAAAAAGGAAAAAGAATTCCAAATTCCAATCAGAAAGAAGCAATGTCCTCCTCCTGCTCCACTGCGCTAACGTCCCACCTCTTTCCCCTCCGCAAAACCAACGACTTCTCCCGCCGCCGCCCTACTTACACACCCTCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020396
ATGTCCTCCTCCTGCTCCACTGCGCTAACGTCCCACCTCTTTCCCCTCCGCAAAACCAACGACTTCTCCCGCCGCCGCCCTACTTACACACCCTCGAGAATTCTTCATCTCTTCAATTCCTCATCAAGCCTGCAGGAAATCAAGGTGCCTCCAGCATCGCCGTCGGATGGGAGGAGCGAGCTGCCGGCGAGCTGGGAGAGCATAGCTCTTCCGCCGGTGACGGCGGCGAAGAGGGTGGTGCTCGTGCGGCACGGCCAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805158.1
MSSSCSTALTSHLFPLRKTNDFSRRRPTYTPSRILHLFNSSSSLQEIKVPPASPSDGRSELPASWESIALPPVTAAKRVVLVRHGQSTWNAEGRIQGSSDFSVLTQKGESQAETSRLMLLDDSFDVCFSSPLIRSKRTAEIIWSSRGEEIITDSNLREIDLYSFQGLLKNEGKAKYGAAFRQWQIDAPNFNIDGHYPVRELWSRARSCWTKILTHESKSILVVAHNAVNQALVATAIGLGTEYFRILLQSNCGVSVLDFT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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