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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001746`

染色体: Chr01 坐标: 32138413-32139448 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001746`
名称	SmilChr01G001746
描述	putative phytosulfokines 6
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32138413 - 32139448 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020813`
GeneID	`131020813`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020813`
原始查询	`SmilChr01G001746`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative phytosulfokines 6
产物	putative phytosulfokines 6
Arabidopsis	`AT3G44735` (PSK3) PHYTOSULFOKINE 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823603] identity=50; qcov=0.538; evalue=2.79e-21; confidence=medium
Rice	`Os12g0147800` (OsPSK3) - identity=50; qcov=0.303; evalue=1.98e-07; confidence=low
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0008083 (growth factor activity); GO:0008283 (cell population proliferation)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF06404 (PSK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020813

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057805829.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805829.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805829.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805829.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805829.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32138619`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A13,A20,A22,B1,B119,B127,B128,B130,B138,B15,B20,B26,B34,B36,B42,B43,B6,B64,B7,B97,C12,C22,C24,C44,C5,C51,C59,C6,C67,C77,C81,C82,C87,D4
`Chr1:32138644`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	107	A1,A10,A11,A15,A16,A19,A20,A21,A22,A24,A25,A5,A8,B1,B100,B103,B105,B106,B107,B11,B111,B118,B119,B12,B124,B125,B127,B128,B130,B132,B135,B136,B138,B15,B19,B20,B21,B26,B32,B33,B35,B36,B40,B42,B43,B47,B48,B50,B54,B56,B58,B6,B60,B61,B62,B64,B69,B7,B70,B71,B72,B80,B83,B84,B85,B9,B93,B96,C1,C12,C13,C16,C19,C21,C22,C26,C27,C29,C31,C38,C40,C41,C43,C44,C5,C50,C52,C53,C55,C56,C58,C59,C62,C65,C67,C68,C74,C8,C80,C81,C82,C84,C87,D4,D5,D6,D7
`Chr1:32138653`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	164	A11,A13,A14,A18,A2,A21,A23,A3,A5,A6,A9,B1,B10,B101,B102,B104,B107,B108,B109,B110,B113,B114,B115,B12,B120,B122,B123,B128,B129,B13,B131,B132,B134,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B17,B18,B2,B21,B22,B23,B24,B25,B27,B28,B29,B3,B31,B33,B34,B35,B37,B4,B41,B44,B46,B47,B49,B5,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B66,B67,B68,B70,B71,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B83,B85,B86,B87,B88,B89,B90,B91,B92,B94,B95,B97,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C17,C18,C19,C20,C21,C22,C23,C24,C28,C3,C30,C33,C35,C37,C39,C4,C41,C42,C43,C44,C46,C47,C49,C50,C51,C52,C54,C56,C57,C60,C61,C64,C65,C66,C68,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C76,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C83,C85,C86,C9,D1,D10,D6
`Chr1:32138666`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A14,C3
`Chr1:32138666`	`AGC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A14,C3
`Chr1:32138667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,B57,B66,B98
`Chr1:32138695`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B122
`Chr1:32138695`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B122
`Chr1:32138753`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	A14,B103,C3
`Chr1:32138753`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	3	A14,B103,C3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805829.1

145 aa

145

PSK

PF06404 PSK 72-145 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805829.1`	Pfam	`PF06404`	PSK	Family	72	145	7.2e-21	75.7	Phytosulfokine precursor protein (PSK)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949846.1
AATATAGTAATGTGATCATTTTAATTGAAACGAAGGGAACAATATTAATAATTTTATATTTTCAAGCTAGTCCACGGCGCGCAACTTGAAACTCAAAATTGACTTATTGAATAGACGAACTTCAGAAACGATCTTTCATCAAATTGAGTTCCAAATAGATCAGCATAAACTTAGGTCACCTTTTAACTCTTACACACAGATCACATGTTTTTCACATCATCTCCAACAACTCAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGAGCATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020813
ATGTTTTTCACATCATCTCCAACAACTCAAAAAAAAAGAAAAAAAAAAGAGCATATTATTACACTGTCCACTGCGTTTTCTCTATGTATTTATACTAGGCATATGCTCCATTCACCTCTCCCAACTCCCAACAAGAATCTCTCTCTCTCACTCTCTCTCTCTCCTCTCTCAACAATGAAGCCGAACATTCACTCAGTTGCACTTCTCCTCATTCTTGTTTTACTCCTCATCACCACCTCACACACTTCTTCCAGAAAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805829.1
MFFTSSPTTQKKRKKKEHIITLSTAFSLCIYTRHMLHSPLPTPNKNLSLSLSLSPLSTMKPNIHSVALLLILVLLLITTSHTSSRKLASKQEINSNKSVTEMEDTDSFPNLMGLEECGNKDEECLNRRILADAHLDYIYTQHHKP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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