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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001753`

染色体: Chr01 坐标: 32254613-32256630 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001753`
名称	SmilChr01G001753
描述	uncharacterized SmilChr01G001753
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32254613 - 32256630 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006450`
GeneID	`131006450`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006450`
原始查询	`SmilChr01G001753`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os12g0539700; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0539700` - identity=40.5; qcov=0.464; evalue=6.82e-72; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14214 (Helitron_like_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006450

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789596.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789596.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789596.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789596.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789596.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32254684`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,D7
`Chr1:32254688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,C77
`Chr1:32254699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B102,C76
`Chr1:32254705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,A3,B76,C59
`Chr1:32254795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr1:32254797`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B132,B134,B84,C57
`Chr1:32254798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A3,C18,C87
`Chr1:32254818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,C80
`Chr1:32254823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B73,B98,C80
`Chr1:32254824`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B83,C35
`Chr1:32254834`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr1:32254839`	`CTT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789596.1

612 aa

306

612

Helitron_like_N

PF14214 Helitron_like_N 115-278 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789596.1`	Pfam	`PF14214`	Helitron_like_N	Domain	115	278	6.9e-49	167.3	Helitron helicase-like domain at N-terminus

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933613.1
ATGGCAAAAGAGAAGATTATTGATCAAGGTCAATCTGATGTCAAGATAAAGCTTATTGGTAGACGACATGGTGATGCTCGAACATATAATCTACCAACCATATCTGAAGTGGCTGCTTTAATAGTTGGTGATTTTGATGAATCGATGGGGGATAGAGATTTAATTGTTGAAACACAAACCGGAGAACTCAAGCGCATTAATGAATTACATGCAGCGTATCTTGGTTTGCAGTATCCATTGTTATTCCCATATGGTGAAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006450
ATGGCAAAAGAGAAGATTATTGATCAAGGTCAATCTGATGTCAAGATAAAGCTTATTGGTAGACGACATGGTGATGCTCGAACATATAATCTACCAACCATATCTGAAGTGGCTGCTTTAATAGTTGGTGATTTTGATGAATCGATGGGGGATAGAGATTTAATTGTTGAAACACAAACCGGAGAACTCAAGCGCATTAATGAATTACATGCAGCGTATCTTGGTTTGCAGTATCCATTGTTATTCCCATATGGTGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789596.1
MAKEKIIDQGQSDVKIKLIGRRHGDARTYNLPTISEVAALIVGDFDESMGDRDLIVETQTGELKRINELHAAYLGLQYPLLFPYGEDGFCEDIPLNVPGSSSGNNARSNVTMKDYFAFRLHERESDATTILTSNRLFQQFVVDAYTMIESSRLMYIRMNQKKMRAGLYKGLTDALIRGETNPATRGKRVILPSSFVGGARYMVQNYQDAMTICKWAGYPNLFITFTCNPKWPEIVRYVEKRGLKPEDRPDIVCRVFKMKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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