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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001775`

染色体: Chr01 坐标: 32658757-32659365 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001775`
名称	SmilChr01G001775
描述	uncharacterized SmilChr01G001775
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32658757 - 32659365 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006527`
GeneID	`131006527`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006527`
原始查询	`SmilChr01G001775`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=22.2; qcov=1.02; evalue=4.19e-09; confidence=weak
Rice	`Os06g0704400` - identity=34.8; qcov=1.01; evalue=8.42e-33; confidence=low
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF04434 (SWIM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006527

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057789665.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057789665.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789665.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789665.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789665.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32658763`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:32658872`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C64,C66
`Chr1:32658872`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:32658884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr1:32658900`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B28,C36,C9,D3
`Chr1:32658972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B52,C8
`Chr1:32658979`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B124,C20,C70
`Chr1:32658980`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81
`Chr1:32658994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C1,C17,C4
`Chr1:32659001`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B15,B24,B9,C85,D6
`Chr1:32659014`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B66,C71
`Chr1:32659016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789665.1

202 aa

101

202

SWIM

PF04434 SWIM 89-117 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789665.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	89	117	1.1e-06	28.8	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933682.1
ATGGTAGACAATAACTGCTCCGAGTCTTTCAATTCCAATATTGTTGATGCTAGGCACAAACCTATTGTTAGTATGCTAGAAGACATTAGGTTGATGTGTATGAAGAGGATTACTGATAGGAAATCTGCATTATTGACTTGGAAGGGTGAATGGGCTCCAAATGTAGTTAGGTTTTTTGATCAAAATAAATCTGACTCCATAAAATGTCATGTAGTCTGGAATGGGGAGTATGGGTATGAAGTCAGTGAGGGTGAAGACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006527
ATGGTAGACAATAACTGCTCCGAGTCTTTCAATTCCAATATTGTTGATGCTAGGCACAAACCTATTGTTAGTATGCTAGAAGACATTAGGTTGATGTGTATGAAGAGGATTACTGATAGGAAATCTGCATTATTGACTTGGAAGGGTGAATGGGCTCCAAATGTAGTTAGGTTTTTTGATCAAAATAAATCTGACTCCATAAAATGTCATGTAGTCTGGAATGGGGAGTATGGGTATGAAGTCAGTGAGGGTGAAGACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789665.1
MVDNNCSESFNSNIVDARHKPIVSMLEDIRLMCMKRITDRKSALLTWKGEWAPNVVRFFDQNKSDSIKCHVVWNGEYGYEVSEGEDRHNVFVDTKKCTCRVWELTGVPCCHTIVVFHFSSIDLMTVISQCYYKEVYAKAYEHVIHHVPGVKFWNVRAEDEVEPPLVEIKVGRPKKNRVRAKHEPRHQHKLGRKGKLQHCSLC

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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