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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001779`

染色体: Chr01 坐标: 32686776-32690199 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001779`
名称	SmilChr01G001779
描述	uncharacterized SmilChr01G001779
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32686776 - 32690199 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020375`
GeneID	`131020375`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020375`
原始查询	`SmilChr01G001779`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	white stripe leaf8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4338875]; symbol=wsl8; hit=Os05g0430200; species=rice; confidence=high
产物	white stripe leaf8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4338875]; symbol=wsl8; hit=Os05g0430200; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G72040` (dNK) P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843535] identity=59.7; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0430200` (wsl8) white stripe leaf8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:4338875] identity=80.3; qcov=0.704; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0019136 (deoxynucleoside kinase activity)
KEGG	-
Pfam	PF01712 (dNK)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020375

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057805128.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.80000	`XP_057805128.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805128.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805128.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805128.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32687157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B49,C25,C75
`Chr1:32687176`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	48	A16,A2,A22,A4,B105,B108,B120,B122,B125,B129,B134,B22,B23,B24,B32,B34,B47,B49,B50,B51,B52,B54,B57,B76,B77,B8,B87,B9,C10,C14,C19,C22,C30,C31,C37,C4,C40,C6,C60,C61,C63,C71,C72,C74,C76,C84,C87,D2
`Chr1:32687233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B64,C9
`Chr1:32687266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:32687297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B79,C18,C4,D1
`Chr1:32687334`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,C66
`Chr1:32687339`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B93
`Chr1:32687463`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B103,C71
`Chr1:32687468`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr1:32687522`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C40
`Chr1:32688994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B117,B40,B70,C65,C85
`Chr1:32689188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B49,C25,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805128.1

571 aa

286

571

dNK

PF01712 dNK 258-512 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805128.1`	Pfam	`PF01712`	dNK	Domain	258	512	2.1e-50	172.0	Deoxynucleoside kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949145.1
GGGGCAATCAATTATATTGCAAATTGTTTTTCAGAGAATGATAGTAGTATTTGCAAAATTGTAAAAAAAGAATTAAAACAAAAATTACTGTACTCAACCCTAAAACCCTCGACCTCTTCTTCTCTTCTCCGCCAAAACCATTTCAACAGCCAAACCCAAACACACAGCAACCGAATTTCTTCTACTCTCTCTCTGTACACTGCTAATCTTACACATTTAACAACAGATATACTTACAAACTTCGTATTCATAGTTTGGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020375
ATGCAGAAGCTTTTGCGCAGGACGCCCGCTGCCGCTCCAATTTCATTCGGTAACAACAGCACTCCTTTCTCTCTACCCGTCTCCGGTTCCAGCTTTCTCTCTCTAGGTCTCTGCAGCGCCCCCCCGGTGATTGCCAATAAAATGTCGTGTCTCCGCCAACCCAACCCCCTGCACCATACCAGAAACCCTTTTTCATCCGCCGCGGTGCGTGGCCTCAAATTAAGGAAATTGCCCCCAACCGGATGCCACCCCTGCAGCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805128.1
MQKLLRRTPAAAPISFGNNSTPFSLPVSGSSFLSLGLCSAPPVIANKMSCLRQPNPLHHTRNPFSSAAVRGLKLRKLPPTGCHPCSCAVDNSSSRNTAPLRAWVVLKENNKYSGLGRAAWFATLAGNSNKGGEFTVAEAGNEKAAEEKRLQRRRSGGGGSGGGAVVVGSPDLLTIPGVGPRNLRKLVEKGFEGVAQLKQLYKDKFFGKSSAKMVEFLQSSVGIIHKNHAESITIFIKESVDEELKESIKPSQKNRITLCV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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