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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001784`

染色体: Chr01 坐标: 32728799-32731830 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001784`
名称	SmilChr01G001784
描述	alpha-(1,4)-fucosyltransferase
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32728799 - 32731830 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020489`
GeneID	`131020489`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020489`
原始查询	`SmilChr01G001784`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha-(1,4)-fucosyltransferase
产物	alpha-(1%2C4)-fucosyltransferase
Arabidopsis	`AT1G71990` (FUT13) fucosyltransferase 13 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843530] identity=68.4; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0432300` (OSJNBa0084A10.15) - identity=55.4; qcov=0.929; evalue=2.09e-156; confidence=high
GO	GO:0006486 (GO:0006486); GO:0016020 (membrane); GO:0036065 (GO:0036065); GO:0046920 (alpha-(1->3)-fucosyltransferase activity)
KEGG	smil00513 (Various types of N-glycan biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00852 (Glyco_transf_10)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020489

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057805324.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057805324.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805324.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805324.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805324.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32729342`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	85	A10,A15,A22,A4,A6,A8,B10,B107,B11,B110,B119,B120,B123,B124,B127,B128,B131,B132,B136,B137,B139,B140,B16,B19,B20,B27,B3,B38,B39,B4,B44,B5,B58,B59,B62,B65,B67,B70,B72,B86,B9,B90,B92,B93,B99,C10,C11,C12,C15,C2,C21,C23,C28,C34,C35,C39,C40,C44,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C54,C56,C57,C59,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C73,C74,C80,C81,C83,C85,C87,D10,D2,D6,D7
`Chr1:32729362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	86	A10,A15,A22,A4,A6,A8,B107,B11,B110,B119,B120,B123,B124,B127,B128,B131,B132,B136,B137,B139,B14,B140,B16,B19,B20,B27,B3,B38,B39,B4,B44,B47,B5,B58,B59,B62,B65,B67,B70,B72,B86,B9,B90,B92,B93,B99,C10,C11,C12,C15,C2,C21,C23,C28,C34,C35,C39,C40,C44,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C54,C56,C57,C59,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C73,C74,C80,C81,C83,C85,C87,D10,D2,D6,D7
`Chr1:32729382`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B77,C2
`Chr1:32729382`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B77,C2
`Chr1:32729416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr1:32729454`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,C48
`Chr1:32729469`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr1:32729516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B98,C48
`Chr1:32731135`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B35,B98,C48
`Chr1:32731372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C35,D11
`Chr1:32731396`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr1:32731426`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A7,B7,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805324.1

408 aa

204

408

Glyco_transf_10

PF00852 Glyco_transf_10 219-402 aa

XP_057805331.1

406 aa

203

406

Glyco_transf_10

PF00852 Glyco_transf_10 217-400 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805324.1`	Pfam	`PF00852`	Glyco_transf_10	Domain	219	402	7e-31	108.0	Glycosyltransferase family 10 (fucosyltransferase) C-term
`XP_057805331.1`	Pfam	`PF00852`	Glyco_transf_10	Domain	217	400	6.9e-31	108.0	Glycosyltransferase family 10 (fucosyltransferase) C-term

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949348.1
AGAATTTTCCAACATTGACTTTAATTTTCTATACTTATTTCAAAGTTCTCTGCTAAAACAAAATTTGGGAATTAAATTGAATCAAGAAAATTTGCTCTAGTTAATTTAAAAATCAAGTCACCTGAAACTAGTCCACCAAACCTCAGAACTTCCATTGCCTAAACCCAGAAAAATTGTATGCAACCGACGAATCACGACCATCTTCCTCTCTCTCTCTAACCTATTCTGCATCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAAATT...

XM_057949341.1
TTTTCCAACATTGACTTTAATTTTCTATACTTATTTCAAAGTTCTCTGCTAAAACAAAATTTGGGAATTAAATTGAATCAAGAAAATTTGCTCTAGTTAATTTAAAAATCAAGTCACCTGAAACTAGTCCACCAAACCTCAGAACTTCCATTGCCTAAACCCAGAAAAATTGTATGCAACCGACGAATCACGACCATCTTCCTCTCTCTCTCTAACCTATTCTGCATCAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAGAAATTTAGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020489
ATGCAACTGAAACCCATAAACACCTTCGCAGTGACACTGATGTTAACCGCTGCGGTGATCATCCTCTTCTTCACCGGATTTCTCGAATTCCCCTCTGCAGATTCCGCAGTCCCATCAGCTAAAGATTCGATCATCTACTCACTTTCGAAATCCGATTCGCCAGAGCCCTTCAGAGATTTGTTCAGAGCATTCAAGAAATGGGATTCCGAGGTGGGCTGCGCCCAATTCAGGGAAAGGCACCGAGATTTGTTGGCGAATGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805324.1
MQLKPINTFAVTLMLTAAVIILFFTGFLEFPSADSAVPSAKDSIIYSLSKSDSPEPFRDLFRAFKKWDSEVGCAQFRERHRDLLANGSKISSLQNAEGGIECGELQMKHVSVLVKGWTWIPDNMDNLYSCRCGLSCLWTKSSVLADKPDALLFETTTPPILRQDGDPLRVYMDLEAGRKRSGYEDIFISYHAKDNVQSTYAGAVFHNNRNYQLSSDKNNDTLVYWSSSRCLPQRNQLAKKILSLLPSHSFGKCLNNVGGL...

XP_057805331.1
MQLKPINTFAVTLMLTAAVIILFFTGFLEFPSADSAVPSAKDSIIYSLSKSDSPEPFRDLFRAFKKWDSEVGCAQFRERHRDLLANGSKISSLQNAEGGIECGELQMKHVSVLVKGWTWIPDNMDNLYSCRCGLSCLWTKSSVLADKPDALLFETTTPPILDGDPLRVYMDLEAGRKRSGYEDIFISYHAKDNVQSTYAGAVFHNNRNYQLSSDKNNDTLVYWSSSRCLPQRNQLAKKILSLLPSHSFGKCLNNVGGLDQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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