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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001786`

染色体: Chr01 坐标: 32738138-32740854 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001786`
名称	SmilChr01G001786
描述	extensin-2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32738138 - 32740854 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020236`
GeneID	`131020236`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020236`
原始查询	`SmilChr01G001786`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	extensin-2-like
产物	extensin-2-like
Arabidopsis	`AT1G21310` (EXT3) extensin 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838728] identity=38.6; qcov=0.549; evalue=1.29e-09; confidence=low
Rice	`-` -
GO	GO:0005199 (structural constituent of cell wall); GO:0009664 (plant-type cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF04554 (Extensin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020236

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057804925.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057804925.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057804925.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057804925.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057804925.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32738251`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr1:32738492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B115,B51,B87,C77,D3
`Chr1:32738503`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr1:32738522`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B27
`Chr1:32738540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A7
`Chr1:32738562`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B50
`Chr1:32738577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B1,B125,B90
`Chr1:32738577`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B125,B90
`Chr1:32738582`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:32738589`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B27,C1,C38
`Chr1:32738660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B13,B55,C64
`Chr1:32738690`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C37,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057804925.1

788 aa

394

788

Extensin_2

PF04554 Extensin_2 32-89 aa PF04554 Extensin_2 81-128 aa PF04554 Extensin_2 119-165 aa PF04554 Extensin_2 157-219 aa PF04554 Extensin_2 307-369 aa PF04554 Extensin_2 383-441 aa PF04554 Extensin_2 433-494 aa PF04554 Extensin_2 470-532 aa PF04554 Extensin_2 698-744 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057804925.1`	Pfam	`PF04554`	Extensin_2	Disordered	32	89	1.4e-65	218.0	Extensin-like region
`XP_057804925.1`	Pfam	`PF04554`	Extensin_2	Disordered	81	128	1.4e-65	218.0	Extensin-like region
`XP_057804925.1`	Pfam	`PF04554`	Extensin_2	Disordered	119	165	1.4e-65	218.0	Extensin-like region
`XP_057804925.1`	Pfam	`PF04554`	Extensin_2	Disordered	157	219	1.4e-65	218.0	Extensin-like region
`XP_057804925.1`	Pfam	`PF04554`	Extensin_2	Disordered	307	369	1.4e-65	218.0	Extensin-like region
`XP_057804925.1`	Pfam	`PF04554`	Extensin_2	Disordered	383	441	1.4e-65	218.0	Extensin-like region
`XP_057804925.1`	Pfam	`PF04554`	Extensin_2	Disordered	433	494	1.4e-65	218.0	Extensin-like region
`XP_057804925.1`	Pfam	`PF04554`	Extensin_2	Disordered	470	532	1.4e-65	218.0	Extensin-like region
`XP_057804925.1`	Pfam	`PF04554`	Extensin_2	Disordered	698	744	1.4e-65	218.0	Extensin-like region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057948942.1
AGCATATCACTAAATTGATGACTATATAAAGGTTCATATTTCTTCAAAGTTCAATCATCAAATACAGAGTAGAAGCCTCAAAATGAAAGAACTTGGGAAAACAGGGCAAATGCCCTTATTCGTATGCCTTCTAATTGTAAGCATTATGATCTCTCAAGTGTCTGCTTTCGATGCTTATGTTTACGCATCTCTCCCTACACCCAAAGAAATTACACATCCCGATTATAAATCATCACCACCTCCAAAAAAGGAAGAATACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020236
ATGAAAGAACTTGGGAAAACAGGGCAAATGCCCTTATTCGTATGCCTTCTAATTGTAAGCATTATGATCTCTCAAGTGTCTGCTTTCGATGCTTATGTTTACGCATCTCTCCCTACACCCAAAGAAATTACACATCCCGATTATAAATCATCACCACCTCCAAAAAAGGAAGAATACACCTACAAATCTCCACCTCCACCACCGAAAAAATACTCATATACCTCTCCCCCACCACCAACATACAAATACAAATCACCTCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057804925.1
MKELGKTGQMPLFVCLLIVSIMISQVSAFDAYVYASLPTPKEITHPDYKSSPPPKKEEYTYKSPPPPPKKYSYTSPPPPTYKYKSPPPPKHVEHPEYTYKSPPPPSKKYSYNSPPPPPYQYKSPPPPKHVEHPEYTYKSPPPPPKKYSYTSPPPPTYEYKSPPPPKHVEHPEYTYKSPPPPPKKYFYSSPPPPPYQYESPSPPKHVEHPEYTYKSPPPPPKKYSYSSPPPPLYQYKSPPPPKHVEHPEYNYKSSPPPPKY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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