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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001794`

染色体: Chr01 坐标: 32813036-32817226 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001794`
名称	SmilChr01G001794
描述	uncharacterized SmilChr01G001794
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	32813036 - 32817226 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020520`
GeneID	`131020520`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020520`
原始查询	`SmilChr01G001794`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0307600` - identity=25; qcov=0.562; evalue=2.64e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020520

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805365.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057805365.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805365.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805365.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805365.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:32813549`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	72	A10,A15,A22,A24,A3,A5,A6,B1,B100,B102,B107,B11,B111,B113,B117,B118,B132,B134,B135,B137,B139,B14,B23,B25,B27,B28,B30,B36,B42,B43,B45,B46,B48,B5,B55,B61,B67,B70,B73,B75,B79,B82,B84,B87,B89,B9,C18,C2,C21,C34,C38,C39,C4,C40,C42,C45,C5,C50,C53,C55,C58,C7,C72,C75,C77,C78,C80,C81,C84,D2,D5,D8
`Chr1:32813570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,C30,C33,C44,C45
`Chr1:32813699`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B26,B94
`Chr1:32813699`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B26,B94
`Chr1:32813719`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	78	A16,A19,A20,A22,A4,A6,A7,A8,B10,B107,B111,B113,B114,B115,B118,B12,B122,B126,B128,B129,B134,B135,B138,B17,B18,B19,B20,B21,B22,B24,B25,B29,B35,B38,B39,B40,B42,B43,B48,B5,B53,B56,B57,B61,B62,B65,B7,B83,B88,B95,B96,B98,C12,C15,C19,C24,C32,C33,C38,C40,C43,C47,C48,C49,C55,C6,C61,C64,C67,C68,C70,C71,C73,C78,C79,C80,D3,D5
`Chr1:32813735`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B131,B66
`Chr1:32813735`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B131,B66
`Chr1:32813740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,B56,B96
`Chr1:32813888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B1,B136,B91
`Chr1:32814000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr1:32814010`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr1:32814032`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C3,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805365.1

363 aa

182

363

DUF8566

PF29561 DUF8566 123-324 aa

XP_057805374.1

363 aa

182

363

DUF8566

PF29561 DUF8566 123-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805365.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	123	324	2.5e-47	162.0	Domain of unknown function (DUF8566)
`XP_057805374.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	123	324	2.5e-47	162.0	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949382.1
AACCGAGAAGGGTAAAAAGGTGAACTCATATTTCACAGAACTTCAGCCGTTCCACAAATCCCGTGAATCACGCCATTGCCTTTCGTAAAAATATTGTTTGTTACGCTATACTGGCAATGATATTTTTTCTTTTAAGCATTATTTTCACCGAATATAGATTTGAAGATTTGATCGCCCTGGTGATTCGTCATCGTCTCAATCGACTGTGAGTTCTGCATTTTTTTTGGATTGAAATATAAACCGTTCATGGATAAAACTTT...

XM_057949391.1
AACCGAGAAGGGTAAAAAGGTGAACTCATATTTCACAGAACTTCAGCCGTTCCACAAATCCCGTGAATCACGCCATTGCCTTTCGTAAAAATATTGTTTGTTACGCTATACTGGCAATGATATTTTTTCTTTTAAGCATTATTTTCACCGAATATAGATTTGAAGATTTGATCGCCCTGGTGATTCGTCATCGTCTCAATCGACTGTGAGTTCTGCATTTTTTTTGGATTGAAATATAAACCGTTCATGGATAAAACTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020520
ATGTTAGTGATGGAGTTGGAGCATGGCAATGATTTTGTCGTTGCAGATACAGCAAGTGATTCTTCAATTTCACCGGATAAGAAAAGAAAAAAGTTACTAAATTCACAGACTTTCAGACGTGATAAAGGAAAAACACCCATTTCATTTCGACCTGCCAGTCGCATCAATATATTTGATGTTACCCCTGTCAAATCCACAGGTTATAACAAGAAGTATCCAAACACTAATGTCAAATATTCTGAACCAGTAACCGTAAGGAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805365.1
MLVMELEHGNDFVVADTASDSSISPDKKRKKLLNSQTFRRDKGKTPISFRPASRINIFDVTPVKSTGYNKKYPNTNVKYSEPVTVRNECIVVDDDNGGELVSKANSIGCPSQITRSKVLSLNTRTTLASFHDSLLKLNAAQQDAIRDTGFGYLLDLTVKELPGRLAYWAPKSFNPKTCELEISSNFRLKVTVDDVYRVFGLPKGVQRIKRFDRQTNHALFDEWFSLFGVGNRDKIKIGLVLNEMVRCKNGGTWFKRHFMI...

XP_057805374.1
MLVMELEHGNDFVVADTASDSSISPDKKRKKLLNSQTFRRDKGKTPISFRPASRINIFDVTPVKSTGYNKKYPNTNVKYSEPVTVRNECIVVDDDNGGELVSKANSIGCPSQITRSKVLSLNTRTTLASFHDSLLKLNAAQQDAIRDTGFGYLLDLTVKELPGRLAYWAPKSFNPKTCELEISSNFRLKVTVDDVYRVFGLPKGVQRIKRFDRQTNHALFDEWFSLFGVGNRDKIKIGLVLNEMVRCKNGGTWFKRHFMI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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