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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001815`

染色体: Chr01 坐标: 33093871-33095487 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001815`
名称	SmilChr01G001815
描述	60S acidic ribosomal protein P2A-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33093871 - 33095487 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020995`
GeneID	`131020995`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020995`
原始查询	`SmilChr01G001815`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S acidic ribosomal protein P2A-like
产物	60S acidic ribosomal protein P2A-like
Arabidopsis	`AT3G44590` (AT3G44590) 60S acidic ribosomal protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823584] identity=65.8; qcov=1; evalue=1.68e-31; confidence=medium
Rice	`Os05g0445500` - identity=68.4; qcov=1; evalue=1.41e-31; confidence=medium
GO	GO:0002182 (cytoplasmic translational elongation); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00428 (Ribosomal_60s)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020995

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806050.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057806050.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806050.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806050.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806050.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33094028`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B114,B4,B46,B73
`Chr1:33094188`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B32,C14
`Chr1:33094241`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B127,C56
`Chr1:33094262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:33094267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B12,C62
`Chr1:33094286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,B12,C62
`Chr1:33094302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:33094317`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr1:33094348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86
`Chr1:33094354`	`TC`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B126,B47,C32,D7
`Chr1:33094370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A16,B12,B121,C62,D10
`Chr1:33094370`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B12,B121,C62,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806050.1

114 aa

114

Ribosomal_60s

PF00428 Ribosomal_60s 17-113 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806050.1`	Pfam	`PF00428`	Ribosomal_60s	Family	17	113	3.7e-26	92.2	60s Acidic ribosomal protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950067.1
ATAGAAAAGCCCAATCGCATAACTGCCGATTAGTTCGGCCCAAATAGAAAAGCCCAATCGCATACCGGCCTGGACCGCCTAAACCCTAACTATAAGAACTAAATCTTCAATCAGGATAAATAGCCGAATTGACGAAGTCGCGATTTCCCCTCTGTAAACCTAGCAGCAGCTTTGATCTTCAGTGGTGCATTTGTCTCTGTTTAACTTCTCAGACATGAAGGTTGTCGCGGCTTACTTGTTGGCGGTTCTGGGTGGGAACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020995
ATGAAGGTTGTCGCGGCTTACTTGTTGGCGGTTCTGGGTGGGAACGCCAGTCCCTCCGCCGAGGATGTAAAGGGCATTTTGAGCTCAGTTGGGGCTGATTGTGACGAGGAAAGAATTGAGTTGCTGTTGTCTCAAGTTGCTGGAAAGGATATTACTGAGTTGATTGCTGCCGGGAGGGAAAAATTGGCTTCAGTACCAGCCGGTGGTGGTGCGGTTGCTGTTTCTGCTTCTCCCAGTGGCGCAGGAGGTGGTGCTGCACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806050.1
MKVVAAYLLAVLGGNASPSAEDVKGILSSVGADCDEERIELLLSQVAGKDITELIAAGREKLASVPAGGGAVAVSASPSGAGGGAAPAAAEAKKEEKVEEKEESDDDMGFGLFD

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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