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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001817`

染色体: Chr01 坐标: 33099523-33102570 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001817`
名称	SmilChr01G001817
描述	flagellar radial spoke protein 5
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33099523 - 33102570 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020961`
GeneID	`131020961`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020961`
原始查询	`SmilChr01G001817`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	flagellar radial spoke protein 5
产物	flagellar radial spoke protein 5
Arabidopsis	`AT2G27680` (AT2G27680) NAD(P)-linked oxidoreductase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817314] identity=85.6; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os09g0567366` (OJ1155_H10.28-1) - identity=83.9; qcov=0.951; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00248 (Aldo_ket_red)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020961

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057806003.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057806003.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057806003.1`
4	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057806003.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806003.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33099638`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C75
`Chr1:33099652`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr1:33099819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr1:33100751`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr1:33101204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr1:33101213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B121,C39
`Chr1:33101240`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr1:33101252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr1:33101253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806003.1

326 aa

163

326

Aldo_ket_red

PF00248 Aldo_ket_red 15-304 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806003.1`	Pfam	`PF00248`	Aldo_ket_red	Domain	15	304	1.4e-66	225.3	Aldo/keto reductase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950020.1
GTATAATTCCCGGCCTTCTGTCGGATTCCGGTGGCCGAGGAGAGCGAGCCACGGAGTTGTGCGGTGTTGCGAGGCGGTGGTCGAGGTGGCGGAGAAGAGGAAAACGGTGGTGAAGAACGGGAACGACTCGCTCGAGATATGCAGGGTGCTCAACGGCATGTGGCAGACCAGCGGCGGATGGGCAGAATCGACCGCGACGACGCCGTCGAGGCGATGCTTCGCTACGCCGACGCCGGCCTCTCCACCTTCGACATGGCTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020961
ATGCAGGGTGCTCAACGGCATGTGGCAGACCAGCGGCGGATGGGCAGAATCGACCGCGACGACGCCGTCGAGGCGATGCTTCGCTACGCCGACGCCGGCCTCTCCACCTTCGACATGGCTGACCACTATGGACCTGCAGAGGATCTTTATGGTATTTTCATAAATAGAGTACGTAGAGAGCGCCCGCCAGAGTACCTTGAAAATGTTAGGGGCCTTACTAAATGGGTGCCTCCACCGGTGAAGATGACTAGTAGCTTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806003.1
MQGAQRHVADQRRMGRIDRDDAVEAMLRYADAGLSTFDMADHYGPAEDLYGIFINRVRRERPPEYLENVRGLTKWVPPPVKMTSSFVRESINVSRKRMDVASLDMLQFHWWDYSNLGYLDALKHLTDLKEEGKIKTVALTNFDTVRLEKILENEIPVVSNQVQHSIVDMRPQQKMAELCQLTGVKLITYGTVMGGLLSEKFLDTNLTIPFAGPPLNTPSLQKYKRMVDAWGGWGLFQGLLQTLKRVATKHGVSISTVAVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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