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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001822`

染色体: Chr01 坐标: 33172479-33173986 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001822`
名称	SmilChr01G001822
描述	uncharacterized SmilChr01G001822
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33172479 - 33173986 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006630`
GeneID	`131006630`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006630`
原始查询	`SmilChr01G001822`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os02g0328500` - identity=34; qcov=0.503; evalue=4.07e-24; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF12776 (Myb_DNA-bind_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006630

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789787.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057789787.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789787.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789787.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057789787.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33172491`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A19,A25,B101,B103,B107,B108,B111,B140,B17,B3,B47,B57,B67,B68,B69,B87,B97,C20,C21,C41,C46,C56,C7,C70,C83,D6
`Chr1:33172997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:33173073`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:33173108`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B134,B15
`Chr1:33173113`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	50	A13,A18,A22,A23,B1,B104,B108,B119,B122,B127,B128,B129,B130,B138,B139,B2,B20,B22,B34,B36,B42,B47,B6,B64,B7,B72,B74,B76,B78,B81,B82,B86,B9,B95,B97,C12,C15,C22,C24,C30,C44,C5,C51,C6,C73,C81,C82,C84,C87,D4
`Chr1:33173125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B119,B122,B72,B81
`Chr1:33173151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:33173156`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B63,C78
`Chr1:33173156`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B63,C78
`Chr1:33173206`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr1:33173218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:33173244`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B10,C2,C3,C47,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789787.1

316 aa

158

316

Myb_DNA-bind_3

PF12776 Myb_DNA-bind_3 27-122 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789787.1`	Pfam	`PF12776`	Myb_DNA-bind_3	Domain	27	122	1.6e-07	32.9	Myb/SANT-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933804.1
ATGAGCTCCGCCCAAACGCAAGGTACCAGTGGCGTCGTCCGCGGTGGTCGGATAAATAAGACCGACCAAACACGTCGTAGTTGGTCGAGTAGAGAGGAGGAGGTTCTTTTGGTGGTGTTGAAAGAGTTAGTTGTGCAAGGTTGGAAATCCGACAATGGATTTCGTGCGGGTTACTTGAATAAATTAGAGGAGGCAATGAAAAAAGATTTTCCACAGACCGATTTGAAAGCTATGCCACACATAAATTCAAAAACAACGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006630
ATGAGCTCCGCCCAAACGCAAGGTACCAGTGGCGTCGTCCGCGGTGGTCGGATAAATAAGACCGACCAAACACGTCGTAGTTGGTCGAGTAGAGAGGAGGAGGTTCTTTTGGTGGTGTTGAAAGAGTTAGTTGTGCAAGGTTGGAAATCCGACAATGGATTTCGTGCGGGTTACTTGAATAAATTAGAGGAGGCAATGAAAAAAGATTTTCCACAGACCGATTTGAAAGCTATGCCACACATAAATTCAAAAACAACGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789787.1
MSSAQTQGTSGVVRGGRINKTDQTRRSWSSREEEVLLVVLKELVVQGWKSDNGFRAGYLNKLEEAMKKDFPQTDLKAMPHINSKTTTWKKNYNSLCGMLEVTGVGFNLDGKHMIDCTNEQWEHIMKKDNNARTMRKKSWPYLEQWSEIFGKDKATGDVAEDLMEAARQTYHNIDLTQTVEVKGDCNFSLDDLNESGHIDDSVSQTHKPEAGVRVPSKKRKNGGGADRMFEAMIEISHSTNGRLDTIAGRMGYDFDVSKAR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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