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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001825`

染色体: Chr01 坐标: 33194132-33195777 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001825`
名称	SmilChr01G001825
描述	uncharacterized SmilChr01G001825
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33194132 - 33195777 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021038`
GeneID	`131021038`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021038`
原始查询	`SmilChr01G001825`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsMB5; symbol=OsMB5; hit=Os03g0792500; species=rice; confidence=weak
产物	OsMB5; symbol=OsMB5; hit=Os03g0792500; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G03740` (BPM4) BTB-POZ and MATH domain 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821170] identity=22.4; qcov=1.13; evalue=3.56e-09; confidence=weak
Rice	`Os03g0792500` (OsMB5) - identity=24.8; qcov=0.99; evalue=3.27e-13; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0016567 (protein ubiquitination)
KEGG	-
Pfam	PF00651 (BTB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021038

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806104.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806104.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057806104.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057806104.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806104.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33194286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:33194290`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	67	A13,A22,A23,A7,B1,B104,B107,B112,B113,B119,B127,B128,B129,B130,B138,B139,B15,B2,B20,B22,B28,B34,B36,B41,B42,B43,B44,B47,B53,B6,B63,B64,B7,B70,B74,B76,B78,B82,B86,B9,B95,B97,C12,C15,C20,C22,C24,C30,C42,C43,C44,C47,C5,C51,C59,C6,C67,C73,C78,C81,C82,C84,C87,C9,D11,D2,D4
`Chr1:33194299`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr1:33194344`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B110,B115,B65,C46,C72
`Chr1:33194446`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,C42,D2
`Chr1:33194458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C14,D11
`Chr1:33194473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr1:33194477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:33194505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B78,C15
`Chr1:33194530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr1:33194538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr1:33194548`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806104.1

293 aa

146

293

BTB

PF00651 BTB 157-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806104.1`	Pfam	`PF00651`	BTB	Domain	157	260	7.7e-05	23.5	BTB/POZ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950121.1
AATTAACGTATCCTATATTATATAATAGATAGATTCTATATATACTCATCACGACAATCGTCGATTCCGCGTGTCATCACCCGCCGTCGCCCGCCTCCTCACTACACATCCGCCGCCAATGGCCAAAATAATGGTAAAAGGGTGTAATGTATATGTGGTGCACAATTACTCAACTATCAAGAAAATGCCGGTGGGGGAATGTACACGAAGCGAAATATTTGATGTGGCTGGTCACTTGTTTAGAATCGTCTTATATCCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021038
ATGGCCAAAATAATGGTAAAAGGGTGTAATGTATATGTGGTGCACAATTACTCAACTATCAAGAAAATGCCGGTGGGGGAATGTACACGAAGCGAAATATTTGATGTGGCTGGTCACTTGTTTAGAATCGTCTTATATCCTCAGGGAATGGATGAGATTGATTACATTAATCAGACTAGTGCATTTACTATTCAGAATGAAAGTGTATCAGAAGTGGAATTGGTGGTTTCGTTTGAGATTCTCCATCCATATCCTTTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806104.1
MAKIMVKGCNVYVVHNYSTIKKMPVGECTRSEIFDVAGHLFRIVLYPQGMDEIDYINQTSAFTIQNESVSEVELVVSFEILHPYPLLGSNVRRSSFHDRLIFRNVLTAQPGLESRCIPFLQPWIASMPRGISDTLKIRATVGVFINALDVPIDRTIFFRAGGERFYAEESVLRTRCRQLHRLACDSNGDVLDADVVLEADIGSDLFCAVLWFIYNKKLQTLDKVDIVRSNMRDPNSWGQSMLRAADRFQLPHLRRMCNSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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