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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001845`

染色体: Chr01 坐标: 33400369-33405408 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001845`
名称	SmilChr01G001845
描述	transmembrane 9 superfamily member 5
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33400369 - 33405408 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021206`
GeneID	`131021206`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021206`
原始查询	`SmilChr01G001845`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transmembrane 9 superfamily member 5
产物	transmembrane 9 superfamily member 5
Arabidopsis	`AT1G08350` (AT1G08350) Endomembrane protein 70 protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837355] identity=51.8; qcov=0.946; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0237000` (OJ1081D05.4) - identity=50.5; qcov=0.998; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0072657 (protein localization to membrane)
KEGG	-
Pfam	PF02990 (EMP70)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021206

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057806290.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057806298.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057806290.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057806290.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057806290.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33402858`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B121
`Chr1:33402893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:33403056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B104,D9
`Chr1:33403082`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr1:33403154`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	44	A23,A3,A6,A8,A9,B105,B106,B108,B113,B12,B127,B134,B137,B20,B22,B25,B27,B3,B35,B37,B51,B55,B65,B66,B69,B73,B77,B84,B89,B91,C15,C30,C36,C37,C5,C51,C60,C61,C80,C81,D11,D4,D5,D7
`Chr1:33403198`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A3,B137,B25,B69,C41,D7
`Chr1:33403511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B21,B82
`Chr1:33403529`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	32	A18,A23,B101,B106,B109,B110,B127,B128,B131,B22,B27,B51,B55,B59,B6,B66,B73,B74,B77,B79,B98,C15,C21,C28,C41,C43,C5,C67,C72,C80,C81,D10
`Chr1:33403546`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B52
`Chr1:33404349`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B2
`Chr1:33404349`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B2
`Chr1:33404427`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806290.1

585 aa

292

585

EMP70

PF02990 EMP70 48-540 aa

XP_057806298.1

557 aa

278

557

EMP70

PF02990 EMP70 36-512 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806290.1`	Pfam	`PF02990`	EMP70	Family	48	540	2.2e-148	495.8	Endomembrane protein 70
`XP_057806298.1`	Pfam	`PF02990`	EMP70	Family	36	512	2.3e-142	476.0	Endomembrane protein 70

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950307.1
GTCTAAATGGTTATTGGGTATTGGTTCACCCAATAACCGAATCGAACCGATTCGGGTTTGGATACCCAAAAACCGATTTTTCGGTTATCGGATCGGTTTTCGGTTAGTATATTTTTAAAATTTTCGGTTATCGGTTAACCCGATAACCGAATCGGGTTAACCGAATAACCGAAAATAAATTAAATTTATACGTAAAAATTATATAATTAGAAAAATTACTACTATTTTCTAATTCTAAATTCCTAATCTAACTGCAAAAG...

XM_057950315.1
GTCTAAATGGTTATTGGGTATTGGTTCACCCAATAACCGAATCGAACCGATTCGGGTTTGGATACCCAAAAACCGATTTTTCGGTTATCGGATCGGTTTTCGGTTAGTATATTTTTAAAATTTTCGGTTATCGGTTAACCCGATAACCGAATCGGGTTAACCGAATAACCGAAAATAAATTAAATTTATACGTAAAAATTATATAATTAGAAAAATTACTACTATTTTCTAATTCTAAATTCCTAATCTAACTGCAAAAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021206
ATGGGAATTTTGAAATCTGCTGTTGTGACTGCTCTGTTACTCCTGCTGCCTATCACTCTTGATTGCGCCAACACCTACAATGCGGGAGATCGCGTGCCCCTTTTCGTCAACAAAATCGGCCCCCTTCACAACCCTAGTGAAACGTATGAATATTACAAGTTGGCCTTCTGTCGTCCAGATCAGGTGATTGAAAAGAAGGAAAGCTTTGGGGAAGTTTTGGGTGGTGATCGATTGGCAAATGCTTTATATGATTTGAGATT...

LOC131021206
ATGCGGGAGATCGCGTGCCCCTTTTCGTCAACAAAATCGGCCCCCTTCACAACCCTAGTGAAACGTATGAATATTACAAGTTGGCCTTCTGTCGTCCAGGTGATTGAAAAGAAGGAAAGCTTTGGGGAAGTTTTGGGTGGTGATCGATTGGCAAATGCTTTATATGATTTGAGATTTGCATTGAACAAAACCCGAGATGCTGTTTGCCAAAAGAAGCTAACTAAGGGCGATATTGCAAAATTCAGGGATGCTATCGCTAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806290.1
MGILKSAVVTALLLLLPITLDCANTYNAGDRVPLFVNKIGPLHNPSETYEYYKLAFCRPDQVIEKKESFGEVLGGDRLANALYDLRFALNKTRDAVCQKKLTKGDIAKFRDAIANDFYYQMYYDDLPLWAYIGKIEDESWKVDGKEKKFLLFTHVHFDALYNGNQVIEINAFSEPSHLVDVTEDVDVEVEFTYSISWKRTSMPYKNRMGRYARASLLHILQQSHWFSFVNSIVIVILLIGLLTLLLLRHLKNDLRKWSIG...

XP_057806298.1
MREIACPFSSTKSAPFTTLVKRMNITSWPSVVQVIEKKESFGEVLGGDRLANALYDLRFALNKTRDAVCQKKLTKGDIAKFRDAIANDFYYQMYYDDLPLWAYIGKIEDESWKVDGKEKKFLLFTHVHFDALYNGNQVIEINAFSEPSHLVDVTEDVDVEVEFTYSISWKRTSMPYKNRMGRYARASLLHILQQSHWFSFVNSIVIVILLIGLLTLLLLRHLKNDLRKWSIGDEDEEKEVGWKYIHGDVFRCPTNLPLFS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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