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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001847`

染色体: Chr01 坐标: 33416451-33417809 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001847`
名称	SmilChr01G001847
描述	uncharacterized SmilChr01G001847
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33416451 - 33417809 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006678`
GeneID	`131006678`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006678`
原始查询	`SmilChr01G001847`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=41.8; qcov=0.786; evalue=4.75e-77; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=46; qcov=0.918; evalue=7.49e-123; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006678

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057789832.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057789832.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057789832.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057789832.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057789832.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33416470`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2
`Chr1:33416473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B105,B109,C6
`Chr1:33416494`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B73,B77,B8,C42
`Chr1:33416528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C35
`Chr1:33416528`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr1:33416556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B132,B26
`Chr1:33416556`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B132,B26
`Chr1:33416573`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,C74
`Chr1:33416591`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr1:33416596`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B22,B54
`Chr1:33416626`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B114,B140,B33,B37,B49,B59,B63,B73,B74,B8,C1,C62,C7
`Chr1:33416632`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B126,B58,B65,B70,C70

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057789832.1

426 aa

213

426

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 72-109 aa PF04827 Plant_tran 180-230 aa PF04827 Plant_tran 231-356 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057789832.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	72	109	4.2e-19	68.7	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057789832.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	180	230	2.6e-84	282.6	Plant transposon protein
`XP_057789832.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	231	356	2.6e-84	282.6	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057933849.1
ATGTCTGTCAATGATAACTCTTCACTTGATTCAAACTCAAGTTCTGATGATTCCCATTCCAATGAATTAGATGAATGGGAAGAACGAGTTTATCAACAAAATCGTCAATTTGATAACATCATCGAGAATATGATCCTAAGCAATACTAATTTGTTTGTAGGACATCAAATTCCAACAAGCAGGAGGAGATATTGTGATAGGGAACGTGAGCTTGGTGCAGAGCGTTTAATCAACGACTATTTTGGTACCAGCCCGACGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006678
ATGTCTGTCAATGATAACTCTTCACTTGATTCAAACTCAAGTTCTGATGATTCCCATTCCAATGAATTAGATGAATGGGAAGAACGAGTTTATCAACAAAATCGTCAATTTGATAACATCATCGAGAATATGATCCTAAGCAATACTAATTTGTTTGTAGGACATCAAATTCCAACAAGCAGGAGGAGATATTGTGATAGGGAACGTGAGCTTGGTGCAGAGCGTTTAATCAACGACTATTTTGGTACCAGCCCGACGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057789832.1
MSVNDNSSLDSNSSSDDSHSNELDEWEERVYQQNRQFDNIIENMILSNTNLFVGHQIPTSRRRYCDRERELGAERLINDYFGTSPTYPPEVFRRRFRMQQTLFLRIVEAAYANDEFFQQRRDATGRLGLSALQKCTAAMRVLAYGTSSDVVDEYLRMSSSATREALVHFVEGVISCFGDTYLRRPNEQDLTRLLYVGEQRGFPGMIGSIDCMHWEWKNYPNAWAGQYTGRSSCNDINVLHRSPIFNDVLEGRAPKVNYVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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