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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001848`

染色体: Chr01 坐标: 33420307-33422898 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001848`
名称	SmilChr01G001848
描述	60S ribosomal protein L10a-1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33420307 - 33422898 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021220`
GeneID	`131021220`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021220`
原始查询	`SmilChr01G001848`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L10a-1
产物	60S ribosomal protein L10a-1
Arabidopsis	`AT1G08360` (AT1G08360) Ribosomal protein L1p/L10e family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837356] identity=90.7; qcov=1; evalue=1.19e-133; confidence=high
Rice	`Os01g0860300` - identity=88; qcov=1; evalue=8.79e-129; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0015934 (large ribosomal subunit)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00687 (Ribosomal_L1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021220

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806311.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057806311.1`
3	Nucleolus	核仁	0.60000	`XP_057806311.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057806311.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806311.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33421282`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr1:33421336`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B123,B125,C41,D3
`Chr1:33421762`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B19,B27,D10
`Chr1:33422692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C28,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806311.1

249 aa

124

249

Ribosomal_L1

PF00687 Ribosomal_L1 22-204 aa

XP_057806318.1

216 aa

108

216

Ribosomal_L1

PF00687 Ribosomal_L1 22-210 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806311.1`	Pfam	`PF00687`	Ribosomal_L1	Domain	22	204	5e-47	160.8	Ribosomal protein L1p/L10e family
`XP_057806318.1`	Pfam	`PF00687`	Ribosomal_L1	Domain	22	210	2.1e-51	175.0	Ribosomal protein L1p/L10e family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950328.1
TCTAAAATTCGGTCACCATATCGAAGTCCGAACCCAACCCACCAAAATAGGTGCTTAGTTGTATCGTCCATAAAGTGGGCTGCTACAAATGGGGCTCTAATTTAAGGCCCAATAAGAATCCTAGTTAGGGTTTGCGCGTCAATATTTATGCTTCTGAATCTGCGCCACTCTCCCTCTCCTTCAGTCATTTCTGCCACCGTCTCACAACCCCTGCTCTAGGGTTTTTCTTCAGTGATTCGGGAAGCTAATTGACCGTGCAC...

XM_057950335.1
TCTAAAATTCGGTCACCATATCGAAGTCCGAACCCAACCCACCAAAATAGGTGCTTAGTTGTATCGTCCATAAAGTGGGCTGCTACAAATGGGGCTCTAATTTAAGGCCCAATAAGAATCCTAGTTAGGGTTTGCGCGTCAATATTTATGCTTCTGAATCTGCGCCACTCTCCCTCTCCTTCAGTCATTTCTGCCACCGTCTCACAACCCCTGCTCTAGGGTTTTTCTTCAGTGATTCGGGAAGCTAATTGACCGTGCAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131021220
ATGAGTAAGCTTCAGAGTGAGGCGCTGAGGGAAGCCATCACAGTGATAGTTGCAAATGCCACTGAGAAGAAGCGCAACTTCACAGAAACTATTGAGCTCCAGATTGGACTCAAGAACTATGACCCCCAAAAGGACAAGCGTTTCAGCGGGTCTGTGAAGTTGCCCCATATTCCAAGACCCAAAATGAAAATATGCATGCTTGGTGATGCCCAGCATGTTGAGGAGGCAGAGAAGATCGGGCTTGAGTCCATGGATGTGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057806311.1
MSKLQSEALREAITVIVANATEKKRNFTETIELQIGLKNYDPQKDKRFSGSVKLPHIPRPKMKICMLGDAQHVEEAEKIGLESMDVEALKKLNKNKKLVKKLAKRYHAFLASEAVIKQIPRLLGPGLNKAGKFPTLVTHQESLEAKVNETKATIKFQLKKVLCMGVAVGNLDMEEKQIFQNVQMSVNFLVSLLKKNWQNVSPVYMFMVFVDRCDFGNWVCLYVVFVIVSGEVLVLEEHHGKATTYLLRS

XP_057806318.1
MSKLQSEALREAITVIVANATEKKRNFTETIELQIGLKNYDPQKDKRFSGSVKLPHIPRPKMKICMLGDAQHVEEAEKIGLESMDVEALKKLNKNKKLVKKLAKRYHAFLASEAVIKQIPRLLGPGLNKAGKFPTLVTHQESLEAKVNETKATIKFQLKKVLCMGVAVGNLDMEEKQIFQNVQMSVNFLVSLLKKNWQNVRCLFLKSTMGKPQRIF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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