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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001853`

染色体: Chr01 坐标: 33467816-33470475 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001853`
名称	SmilChr01G001853
描述	double-stranded RNA-binding protein 1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	33467816 - 33470475 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021273`
GeneID	`131021273`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021273`
原始查询	`SmilChr01G001853`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	double-stranded RNA-binding protein 1-like
产物	double-stranded RNA-binding protein 1-like
Arabidopsis	`AT1G09700` (HYL1) dsRNA-binding domain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837498] identity=63.2; qcov=0.518; evalue=7.76e-82; confidence=medium
Rice	`Os12g0109900` (OsRBP) - identity=63.3; qcov=0.513; evalue=1.1e-71; confidence=medium
GO	GO:0003725 (double-stranded RNA binding); GO:0004525 (ribonuclease III activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0010468 (regulation of gene expression)
KEGG	-
Pfam	PF00035 (dsrm)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021273

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057806375.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806375.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806375.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057806375.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057806375.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:33468298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,B7,C6,C63,C67
`Chr1:33468332`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr1:33468588`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B40,B78
`Chr1:33468737`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:33468807`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D9
`Chr1:33469564`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C10,C64,C77

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806375.1

388 aa

194

388

dsrm

PF00035 dsrm 66-131 aa PF00035 dsrm 152-215 aa

XP_057806385.1

388 aa

194

388

dsrm

PF00035 dsrm 66-131 aa PF00035 dsrm 152-215 aa

XP_057806393.1

388 aa

194

388

dsrm

PF00035 dsrm 66-131 aa PF00035 dsrm 152-215 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806375.1`	Pfam	`PF00035`	dsrm	Domain	66	131	1.8e-33	115.6	Double-stranded RNA binding motif
`XP_057806375.1`	Pfam	`PF00035`	dsrm	Domain	152	215	1.8e-33	115.6	Double-stranded RNA binding motif
`XP_057806385.1`	Pfam	`PF00035`	dsrm	Domain	66	131	1.8e-33	115.6	Double-stranded RNA binding motif
`XP_057806385.1`	Pfam	`PF00035`	dsrm	Domain	152	215	1.8e-33	115.6	Double-stranded RNA binding motif
`XP_057806393.1`	Pfam	`PF00035`	dsrm	Domain	66	131	1.8e-33	115.6	Double-stranded RNA binding motif
`XP_057806393.1`	Pfam	`PF00035`	dsrm	Domain	152	215	1.8e-33	115.6	Double-stranded RNA binding motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950392.1
GAAAAATCTCGTCGCTTTTAATAGTGAAAAATTCTTGCTTCTGTTTTGATTGCTGCTCACTGCAATTTCTGTCATAGCCATGCCCAAACTCTGAGGACTATCTACACCGTGCCACTCTCATCTTAGCCTCCGTCGATCCCCAACTCCACTTATTCTCCGATAGAAAAGGGAGTTGTGGTAAAGGGGTTCGGACAACTTGAAAGTATTTCAGATGGAAGCTGGTCAGATTGATGTTGATGGTAGCGTTGGAATTATGACTG...

XM_057950402.1
GTCGCTTTTAATAGTGAAAAATTCTTGCTTCTGTTTTGATTGCTGCTCACTGCAATTTCTGTCATAGCCATGCCCAAACTCTGAGGACTATCTACACCGTGCCACTCTCATCTTAGCCTCCGTCGATCCCCAACTCCACTTATTCTCCGTCGATTGAATCGCAGATAGAAAAGGGAGTTGTGGTAAAGGGGTTCGGACAACTTGAAAGTATTTCAGATGGAAGCTGGTCAGATTGATGTTGATGGTAGCGTTGGAATTAT...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131021273
ATGGAAGCTGGTCAGATTGATGTTGATGGTAGCGTTGGAATTATGACTGGGACAACTTGCAACCCTCCAACCCCTCCAGCTCAGGAGGAAATTGACTCCACCCGAGCATCGTCTGCAAAGATGAAGGTGAAGGGCACCAATCAGGAATCACAAGAGAAAGATAAACCTCCAAGTGTCGCAAACTGTTATGTCTTTAAGAGTCAACTGCAAGAATATTGTCAGAAAACAGGATTAACTACTCCAGTTTATGAAACTATCAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057806375.1
MEAGQIDVDGSVGIMTGTTCNPPTPPAQEEIDSTRASSAKMKVKGTNQESQEKDKPPSVANCYVFKSQLQEYCQKTGLTTPVYETIKEGPSHEPYFRSTVVLNNVRYDSLPGFFNRKAAEQSAAEVALIELAKSNNMNCGISQPVHETGLCKNLLQEYAQKMNYAIPLYECRKEEKEGKMPMYSCVVEIGSIKYIGASAGTKKEAERKAARTALLAIQTAVPISEDHTDNSIYTVIPQKKKASDLAISSQETKASLKSKK...

XP_057806385.1
MEAGQIDVDGSVGIMTGTTCNPPTPPAQEEIDSTRASSAKMKVKGTNQESQEKDKPPSVANCYVFKSQLQEYCQKTGLTTPVYETIKEGPSHEPYFRSTVVLNNVRYDSLPGFFNRKAAEQSAAEVALIELAKSNNMNCGISQPVHETGLCKNLLQEYAQKMNYAIPLYECRKEEKEGKMPMYSCVVEIGSIKYIGASAGTKKEAERKAARTALLAIQTAVPISEDHTDNSIYTVIPQKKKASDLAISSQETKASLKSKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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