当前解析结果
SmilChr01G001871| 统一新 Gene ID | SmilChr01G001871 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G001871 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G001871 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 33733246 - 33734628 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131006760 |
|---|---|
| GeneID | 131006760 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131006760 |
| 原始查询 | SmilChr01G001871 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131006760 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057789874.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 1.00000 | XP_057789874.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 1.00000 | XP_057789874.1 |
| 4 | Nuclear body | 核内小体 | 0.20000 | XP_057789874.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057789874.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:33733300 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C47,C69 |
Chr1:33733473 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr1:33733489 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B129 |
Chr1:33733510 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B112 |
Chr1:33733552 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B111,B28,C51,C68 |
Chr1:33733558 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 36 | A1,A14,A16,A8,B111,B112,B119,B128,B21,B25,B29,B35,B37,B40,B45,B5,B53,B57,B86,B87,B89,B96,C1,C11,C15,C17,C19,C25,C38,C40,C44,C5,C79,C8,D3,D5 |
Chr1:33733591 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B129 |
Chr1:33733597 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B81,C74,C81 |
Chr1:33733675 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B104,B79,C12,C18 |
Chr1:33733699 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B28,C29 |
Chr1:33733701 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B26,B85,D10 |
Chr1:33733718 |
G |
GT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 3 | B84,C16,C43 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。