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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001896`

染色体: Chr01 坐标: 34081061-34086475 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001896`
名称	SmilChr01G001896
描述	uncharacterized SmilChr01G001896
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34081061 - 34086475 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021637`
GeneID	`131021637`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021637`
原始查询	`SmilChr01G001896`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	confidence=no_hit
产物	confidence=no_hit
Arabidopsis	`-` -
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021637

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057806878.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057806878.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057806878.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806878.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806878.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34081568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:34081629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B36,C45,C62
`Chr1:34081660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C27
`Chr1:34081660`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr1:34081709`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B50,C21
`Chr1:34081764`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B123,B55,C9
`Chr1:34081784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C53,D3
`Chr1:34081791`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B6
`Chr1:34081793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C53,D3
`Chr1:34081798`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B29,B41,C64
`Chr1:34081807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	C41,D10
`Chr1:34081807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C41,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806878.1

416 aa

208

416

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 244-313 aa

XP_057806885.1

416 aa

208

416

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 244-313 aa

XP_057806889.1

416 aa

208

416

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 244-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806878.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	244	313	4e-10	40.6	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
`XP_057806885.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	244	313	4e-10	40.6	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain
`XP_057806889.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	244	313	4e-10	40.6	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950906.1
AGAGAAGTGTAACAGCATCTGCTTAAGAAAAAAACAGCAGTAGTAGCAGCAATGGCGGCGGAGCTTCCAAATTTCATCGTGGTGAGGGCAAGCGTCCAACAGCGGTACGTGTCGCACTTCAAGGGGCTGGAACTTCACAGGCGCCACCGAAGTCAACATTTTCAGCCCACTGGCGCAGATCCAAGTAGAGCAGGCCAAAAGCGACTCCCGCTACGTTCACTTCCGCTTCGTCCACACCAACAACGCCATGCAAATCATCG...

XM_057950902.1
AGAGAAGTGTAACAGCATCTGCTTAAGAAAAAAACAGCAGTAGTAGCAGCAATGGCGGCGGAGCTTCCAAATTTCATCGTGGTGAGGGCAAGCGTCCAACAGCGGTACGTGTCGCACTTCAAGGGGCTGGAACTTCACAGGCGCCACCGAAGTCAACATTTTCAGCCCACTGGCGCAGATCCAAGTAGAGCAGGCCAAAAGCGACTCCCGCTACGTTCACTTCCGCTTCGTCCACACCAACAACGCCATGCAAATCATCG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131021637
ATGATCAAGTGGAGATTCGCAACCCGCAACAAATTCATCTCAATCCATATATTTTGGATTTGTACACATTTTTTGTATTTCATTAAATTGAATACAATAAAATTTGTGTTTACAAATTTTGGCACGCCCGGTGGGACATCTCTACCTCTCATCTCTCATTTTCACCAACAGCAACTCAAGCAAATTCAAATGGAGAACAAAGCTTCAAGTGCTGCCCTAAACATCACTTTGGAGAACATTGGTGTTATCACTCGAGGCAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057806878.1
MIKWRFATRNKFISIHIFWICTHFLYFIKLNTIKFVFTNFGTPGGTSLPLISHFHQQQLKQIQMENKASSAALNITLENIGVITRGKAMQLEEIFKPASAMEEHSTASYYLEAPVMVTNASTLEEQVASIAKLLESMNKRTLEQDAKISKLILEKGEGSRVNDEKDEKSDDSESFEKHHEEKTPPKNIEVSADGFIHINQLKDFIMGTVKDKFEGTSKSAWTYSKPYTTRIDSLKMPIGYQPPKFQQFDGKGNPKQHVAH...

XP_057806885.1
MIKWRFATRNKFISIHIFWICTHFLYFIKLNTIKFVFTNFGTPGGTSLPLISHFHQQQLKQIQMENKASSAALNITLENIGVITRGKAMQLEEIFKPASAMEEHSTASYYLEAPVMVTNASTLEEQVASIAKLLESMNKRTLEQDAKISKLILEKGEGSRVNDEKDEKSDDSESFEKHHEEKTPPKNIEVSADGFIHINQLKDFIMGTVKDKFEGTSKSAWTYSKPYTTRIDSLKMPIGYQPPKFQQFDGKGNPKQHVAH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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