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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001903`

染色体: Chr01 坐标: 34138139-34140145 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001903`
名称	SmilChr01G001903
描述	peroxidase 60-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34138139 - 34140145 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021695`
GeneID	`131021695`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021695`
原始查询	`SmilChr01G001903`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peroxidase 60-like
产物	peroxidase 60-like
Arabidopsis	`AT5G22410` (RHS18) root hair specific 18 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832302] identity=52; qcov=0.976; evalue=9.49e-108; confidence=high
Rice	`Os09g0323700` (prx121) - identity=51.5; qcov=0.921; evalue=1.12e-94; confidence=high
GO	GO:0004601 (peroxidase activity); GO:0006979 (response to oxidative stress); GO:0009505 (plant-type cell wall); GO:0009506 (plasmodesma); GO:0020037 (heme binding); GO:0042744 (hydrogen peroxide catabolic process)
KEGG	smil00940 (Phenylpropanoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00141 (peroxidase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021695

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057806959.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057806959.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057806959.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057806959.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057806959.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34139555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B98,C48,D11
`Chr1:34139675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057806959.1

331 aa

166

331

peroxidase

PF00141 peroxidase 49-292 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057806959.1`	Pfam	`PF00141`	peroxidase	Domain	49	292	8.8e-79	265.3	Peroxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057950976.1
ATCAACCACTCCTTCCAATAATACATAAAATAGTATAAATCTTTAATTTCTAATTTTAAAAATGTCAAGTTCGAGCTTAAGCTTGATGGTAACAACAGCCTTAGTCTTGGCCGCCTTGTGCGGCCAGAGCCAGGGCGCCGCCGCCCCTCTTCAAGTAGGGTTCTATAAAGGAAAATGCGGCTCCGCCGACGTCGAGGCCGTCGTATACGGCGTCGTTAGAGCGTGGTTCGCCACCAAGGATAACACCATCGCAGCTGCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021695
ATGTCAAGTTCGAGCTTAAGCTTGATGGTAACAACAGCCTTAGTCTTGGCCGCCTTGTGCGGCCAGAGCCAGGGCGCCGCCGCCCCTCTTCAAGTAGGGTTCTATAAAGGAAAATGCGGCTCCGCCGACGTCGAGGCCGTCGTATACGGCGTCGTTAGAGCGTGGTTCGCCACCAAGGATAACACCATCGCAGCTGCTCTTCTACGCATGCAGTTTCATGACTGCTTTGTCAATGGGTGCGATGCATCAATTCTATTGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057806959.1
MSSSSLSLMVTTALVLAALCGQSQGAAAPLQVGFYKGKCGSADVEAVVYGVVRAWFATKDNTIAAALLRMQFHDCFVNGCDASILLDGGNNTEKAAIPNLSVRGYELIDAVKAVVEAACPGVVSCADIIVMATRDAVALSEGGRYMVQTGRRDGTISLAKNVDLPIPSVSVSDSIQAFAKKGLTATDMIYLLGGHTVGVTHCSLIRSRLYNFGGTGQADPNMDAALVAALRARCPQNATMVDNTVNLDQNPLSSMVVDNS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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