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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001936`

染色体: Chr01 坐标: 34555603-34556645 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001936`
名称	SmilChr01G001936
描述	transcription repressor OFP4-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34555603 - 34556645 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021936`
GeneID	`131021936`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021936`
原始查询	`SmilChr01G001936`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription repressor OFP4-like
产物	transcription repressor OFP4-like
Arabidopsis	`AT2G36026` (AT2G36026) Ovate family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:6241209] identity=66.2; qcov=0.319; evalue=4.83e-25; confidence=low
Rice	`Os02g0679700` (OsOFP6) - identity=59.1; qcov=0.324; evalue=1.62e-21; confidence=low
GO	GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF04844 (Ovate)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021936

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057807265.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057807265.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057807265.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057807265.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807265.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34555976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:34555977`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,B51,C33
`Chr1:34556020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:34556025`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr1:34556060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B122,B126,C45
`Chr1:34556178`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:34556252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B61,C45,C62
`Chr1:34556458`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	15	A13,A25,B105,B32,B47,B80,B98,C11,C21,C22,C47,C48,C51,C69,C81
`Chr1:34556540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B125,B28,B85,B87,C42
`Chr1:34556554`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	41	A13,A15,A25,A6,A7,B105,B121,B135,B138,B2,B3,B32,B38,B39,B47,B67,B69,B80,B84,B9,B98,C11,C12,C13,C15,C19,C22,C28,C29,C38,C42,C44,C47,C48,C51,C54,C69,C70,C71,C81,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807265.1

204 aa

102

204

Ovate

PF04844 Ovate 140-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807265.1`	Pfam	`PF04844`	Ovate	Family	140	194	4e-25	88.3	Transcriptional repressor, ovate

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951282.1
AAAAATGTCATTAATATCATTGAAGCAAGAAAAACGAAAGTTGAAATCATGGTCTACAAATAACCAATGATAAAGAAACTTTTTAAATCTCACCCTAAATCCCACCATATTAAAAAATCTCTCCAGCCAAGTCTTCCTCATACTACCAAACACCCACCAAATCACCGCCGCCGCGCCGCCGCACACATGTCTTCCGACAAGATACACAAACTGAAGAGCATATTCACCGCAAGCGGCGGCTGCGGCTGCCGCCCAAAGCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131021936
ATGATAAAGAAACTTTTTAAATCTCACCCTAAATCCCACCATATTAAAAAATCTCTCCAGCCAAGTCTTCCTCATACTACCAAACACCCACCAAATCACCGCCGCCGCGCCGCCGCACACATGTCTTCCGACAAGATACACAAACTGAAGAGCATATTCACCGCAAGCGGCGGCTGCGGCTGCCGCCCAAAGCCCGCCGACATCGTCGAGCCACAAACCAAGCCGAAACCCTCATTCTCCGATCAGAAATCCACCCTCCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807265.1
MIKKLFKSHPKSHHIKKSLQPSLPHTTKHPPNHRRRAAAHMSSDKIHKLKSIFTASGGCGCRPKPADIVEPQTKPKPSFSDQKSTLLPSSSATSAAEDDAWSSTTFSLTADASPHHHTVFSKTGGSCPKIHNSFAVVKDSDDPYHDFRQSMLQMICEKKMYSRNDLQQLLDCFLKLNSPRHHEVIVRAFVEIWSGGKEAPPRSM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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