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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001938`

染色体: Chr01 坐标: 34576957-34578623 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001938`
名称	SmilChr01G001938
描述	transcription factor E2FB-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34576957 - 34578623 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131006982`
GeneID	`131006982`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131006982`
原始查询	`SmilChr01G001938`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor E2FB-like
产物	transcription factor E2FB-like
Arabidopsis	`AT5G22220` (E2F1) E2F transcription factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832283] identity=51.3; qcov=0.962; evalue=2.57e-62; confidence=high
Rice	`Os02g0537500` (OsE2F1) - identity=57.4; qcov=0.883; evalue=1.41e-71; confidence=high
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity); GO:0090575 (RNA polymerase II transcription regulator complex)
KEGG	-
Pfam	PF16421 (E2F_CC-MB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131006982

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790108.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057790108.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790108.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790108.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790108.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34577904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B54,B82,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790108.1

239 aa

120

239

E2F_CC-MB

PF16421 E2F_CC-MB 15-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790108.1`	Pfam	`PF16421`	E2F_CC-MB	Domain	15	114	1.7e-34	118.5	E2F transcription factor CC-MB domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934125.1
TTTGGGGAGTTGCTAACTCCTTATCAATTCTTTGATCCTGTGCAGGAAGAAATACAAAACTTGAATTCAGAGGAGTGCAGATTAGACGAGCGCATAAGAGAAATGCAGGAAAAGTTAAGGGGGCTAAGCGAAGAAGAAGACAATCAAAGGTGGCTTTTTATTACTGAAGAAGATGTCAAAAACCTACCGTGCTTCGAGAATGAAACTCTGATAGCTATTAAAGCTCCACACGGCACGACTCTGGAAGTTCCTGAACCCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131006982
TTTGGGGAGTTGCTAACTCCTTATCAATTCTTTGATCCTGTGCAGGAAGAAATACAAAACTTGAATTCAGAGGAGTGCAGATTAGACGAGCGCATAAGAGAAATGCAGGAAAAGTTAAGGGGGCTAAGCGAAGAAGAAGACAATCAAAGGTGGCTTTTTATTACTGAAGAAGATGTCAAAAACCTACCGTGCTTCGAGAATGAAACTCTGATAGCTATTAAAGCTCCACACGGCACGACTCTGGAAGTTCCTGAACCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790108.1
FGELLTPYQFFDPVQEEIQNLNSEECRLDERIREMQEKLRGLSEEEDNQRWLFITEEDVKNLPCFENETLIAIKAPHGTTLEVPEPDEAGDYPQRRYKIVLRSTMGPIDVYLVSQFEEINAYEAQPSNLDTSVANETPTEEITRDEIIGQGEGVQRMCLETSSSHDFVSGIMKIVPDADSDADYYLLSETDVSITDMWRTEDEVDWDTLNTLHEGYPVSIISPSRDQAPRPSIVPSAGS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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