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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001939`

染色体: Chr01 坐标: 34582458-34586905 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001939`
名称	SmilChr01G001939
描述	transcription factor E2FB-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34582458 - 34586905 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021964`
GeneID	`131021964`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021964`
原始查询	`SmilChr01G001939`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor E2FB-like
产物	transcription factor E2FB-like
Arabidopsis	`AT5G22220` (E2F1) E2F transcription factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832283] identity=54.8; qcov=0.951; evalue=3.02e-122; confidence=high
Rice	`Os02g0537500` (OsE2F1) - identity=58.1; qcov=0.927; evalue=7.6e-123; confidence=high
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0000981 (DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0046983 (protein dimerization activity); GO:0090575 (RNA polymerase II transcription regulator complex)
KEGG	-
Pfam	PF02319 (WHD_E2F_TDP); PF16421 (E2F_CC-MB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021964

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807284.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057807284.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.60000	`XP_057807284.1`
4	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057807297.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807284.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34583270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B41
`Chr1:34583405`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B14,B24
`Chr1:34584155`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B129
`Chr1:34584871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr1:34585394`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A5,B35,B76
`Chr1:34585394`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A5,B35,B76
`Chr1:34586402`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C1

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807284.1

429 aa

214

429

WHD_E2F_TDP

E2F_CC-MB

PF02319 WHD_E2F_TDP 119-182 aa PF16421 E2F_CC-MB 199-304 aa

XP_057807291.1

423 aa

212

423

WHD_E2F_TDP

E2F_CC-MB

PF02319 WHD_E2F_TDP 119-182 aa PF16421 E2F_CC-MB 199-298 aa

XP_057807297.1

384 aa

192

384

WHD_E2F_TDP

E2F_CC-MB

PF02319 WHD_E2F_TDP 74-137 aa PF16421 E2F_CC-MB 154-259 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807284.1`	Pfam	`PF02319`	WHD_E2F_TDP	Domain	119	182	1e-25	90.0	E2F/DP family winged-helix DNA-binding domain
`XP_057807284.1`	Pfam	`PF16421`	E2F_CC-MB	Domain	199	304	1.9e-33	115.1	E2F transcription factor CC-MB domain
`XP_057807291.1`	Pfam	`PF02319`	WHD_E2F_TDP	Domain	119	182	9.8e-26	90.0	E2F/DP family winged-helix DNA-binding domain
`XP_057807291.1`	Pfam	`PF16421`	E2F_CC-MB	Domain	199	298	3.3e-34	117.6	E2F transcription factor CC-MB domain
`XP_057807297.1`	Pfam	`PF02319`	WHD_E2F_TDP	Domain	74	137	8.4e-26	90.2	E2F/DP family winged-helix DNA-binding domain
`XP_057807297.1`	Pfam	`PF16421`	E2F_CC-MB	Domain	154	259	1.6e-33	115.4	E2F transcription factor CC-MB domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951308.1
AATATGATCGAGTACAAACTCAATGAAAAATATACTCCATAAACATGAAGCTACGGAAACTCGACTTACATTTGAACTCATTAAAATAAATAAACAAACACAAGATTTGACTCGTTACAATCTATTTCCCACTTACTATCTTTTCCCTCCTTTAGTTTACCTTTTTCTTTCCCTCTTTGCGCATTCCTTCTCCCTCAAATTCACATCCCTCACTTCCATTGCTCCCCAATTTCCCCTCCAAATTTTTTTTCTCTCTCTCT...

XM_057951301.1
CCATAAACATGAAGCTACGGAAACTCGACTTACATTTGAACTCATTAAAATAAATAAACAAACACAAGATTTGACTCGTTACAATCTATTTCCCACTTACTATCTTTTCCCTCCTTTAGTTTACCTTTTTCTTTCCCTCTTTGCGCATTCCTTCTCCCTCAAATTCACATCCCTCACTTCCATTGCTCCCCAATTTCCCCTCCAAATTTTTTTTCTCTCTCTCTCTCAGTTTCCCTTCCTTTATCTCTCCCCGCAAAGAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131021964
ATGAAGCCGCCGTTCGGTGGAGGCGGCCGCGTTGACTACCGCCGCTTCACCGCTGTTGGCTCTCATCCCAATCCAGAACTCGACGAAGCCGTTGTCATAAAGACGCCGCCGCCTTCATTGAAACGGAAGAGTGGAATGGCTGACTATGGCACGATATCTGTTGAGCAAAATGTAAGTCCTGGCACCAGTGCTTTCATGAACAGCCCTCACCGGACTCCAGTTTCAGTGAAATCTGAGAAACCCCAGAAGGTTCCTAAGTC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057807284.1
MKPPFGGGGRVDYRRFTAVGSHPNPELDEAVVIKTPPPSLKRKSGMADYGTISVEQNVSPGTSAFMNSPHRTPVSVKSEKPQKVPKSTKANRVSCQSLMTNTGSPTGDNLTPVGSCRYDSSLALLTKKFINLIKHSEGGILELNKAAETLEVQKRRIYDITNVLEGIGLIEKTLKNIIQWKGTDVRRPGEVDETLPDIQEEIQNLNSEECRLDERIREMQEKLRGLSEEEDNQRWLFITEEDVKNLPCFENETLIAIKAP...

XP_057807291.1
MKPPFGGGGRVDYRRFTAVGSHPNPELDEAVVIKTPPPSLKRKSGMADYGTISVEQNVSPGTSAFMNSPHRTPVSVKSEKPQKVPKSTKANRVSCQSLMTNTGSPTGDNLTPVGSCRYDSSLALLTKKFINLIKHSEGGILELNKAAETLEVQKRRIYDITNVLEGIGLIEKTLKNIIQWKGTDVRRPGEVDETLPDIQEEIQNLNSEECRLDERIREMQEKLRGLSEEEDNQRWLFITEEDVKNLPCFENETLIAIKAP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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