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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001940`

染色体: Chr01 坐标: 34587467-34605641 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001940`
名称	SmilChr01G001940
描述	uncharacterized SmilChr01G001940
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34587467 - 34605641 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131021988`
GeneID	`131021988`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131021988`
原始查询	`SmilChr01G001940`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl/glutamyl-tRNA (Asn/Gln) amidotransferase subunit B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832282]; symbol=AT5G22210; hit=AT5G22210; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	aspartyl/glutamyl-tRNA (Asn/Gln) amidotransferase subunit B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832282]; symbol=AT5G22210; hit=AT5G22210; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G22210` (AT5G22210) aspartyl/glutamyl-tRNA (Asn/Gln) amidotransferase subunit B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832282] identity=66.2; qcov=1.03; evalue=2.92e-25; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25111 (AtTam9)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131021988

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057807307.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057807307.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057807307.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807307.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807307.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34596140`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr1:34596145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:34596177`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr1:34596201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr1:34596225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B49,B62,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807307.1

78 aa

AtTam9

PF25111 AtTam9 1-78 aa

XP_057807316.1

78 aa

AtTam9

PF25111 AtTam9 1-78 aa

XP_057807326.1

78 aa

AtTam9

PF25111 AtTam9 1-78 aa

XP_057807334.1

78 aa

AtTam9

PF25111 AtTam9 1-78 aa

XP_057807343.1

78 aa

AtTam9

PF25111 AtTam9 1-78 aa

XP_057807353.1

78 aa

AtTam9

PF25111 AtTam9 1-78 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807307.1`	Pfam	`PF25111`	AtTam9	Family	1	78	2.7e-46	156.5	AtTam9 family
`XP_057807316.1`	Pfam	`PF25111`	AtTam9	Family	1	78	2.7e-46	156.5	AtTam9 family
`XP_057807326.1`	Pfam	`PF25111`	AtTam9	Family	1	78	2.7e-46	156.5	AtTam9 family
`XP_057807334.1`	Pfam	`PF25111`	AtTam9	Family	1	78	2.7e-46	156.5	AtTam9 family
`XP_057807343.1`	Pfam	`PF25111`	AtTam9	Family	1	78	2.7e-46	156.5	AtTam9 family
`XP_057807353.1`	Pfam	`PF25111`	AtTam9	Family	1	78	2.7e-46	156.5	AtTam9 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

13 records

下载 cDNA FASTA

XR_009101129.1
AATACATATATTTATAAGGTCCTGTCAGTTTCCTCTATAAATTTCAGCCATTCTCGCCCATTCGATCACACACAAAGCAGCTTAACTCTTCACCCAACACACAACTCATATCTGCTATCTCCTGCAAAATATCGAACCAATTCATCACAGCTCAAATCTGCTACCTCCTGCAAAATAGCAAAGAGAGTTGTAATCATCTTTAAAGATTATCTTGTAGGTCCACTTGATAGAAGGCTTTAGCATTGGCTTTACAACGCAAG...

XR_009101124.1
ATACATATATTTATAAGGTCCTGTCAGTTTCCTCTATAAATTTCAGCCATTCTCGCCCATTCGATCACACACAAAGCAGCTTAACTCTTCACCCAACACACAACTCATATCTGCTATCTCCTGCAAAATATCGAACCAATTCATCACAGCTCAAATCTGCTACCTCCTGCAAAATAGCAAAGAGAGTTGTAATCATCTTTAAAGATTTACATCATAGCAGAATTCTCATAAAGGTCCACTTGATAGAAGGCTTTAGCATT...

CDS

6 records

下载 CDS FASTA

LOC131021988
ATGGGAAATAAACCTGCAAAGCCTGAGAAGAAGGAAGAGTTGTTCCTGAAAATTGTTCCTCCTCTTGACCGTGCATATACTCGTTGGCTTGCTCGGGATCTTGATAGGATTTATGGTTTCACTCCACGAAATCCACGTGCCATAAAGCCCCCAGACCACTATATTGAATACATGCGTATGAACGGCTGGTTGGACCTGGACCTGAATGATCCCGACCTTGCACATTTATTCAAGTGA

Protein

6 records

下载 Protein FASTA

XP_057807307.1
MGNKPAKPEKKEELFLKIVPPLDRAYTRWLARDLDRIYGFTPRNPRAIKPPDHYIEYMRMNGWLDLDLNDPDLAHLFK

XP_057807316.1
MGNKPAKPEKKEELFLKIVPPLDRAYTRWLARDLDRIYGFTPRNPRAIKPPDHYIEYMRMNGWLDLDLNDPDLAHLFK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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