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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001960`

染色体: Chr01 坐标: 34853780-34859457 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001960`
名称	SmilChr01G001960
描述	transcription factor LHW-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	34853780 - 34859457 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022183`
GeneID	`131022183`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022183`
原始查询	`SmilChr01G001960`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor LHW-like
产物	transcription factor LHW-like
Arabidopsis	`AT2G27230` (LHW) transcription factor-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817265] identity=53.5; qcov=0.431; evalue=7.24e-108; confidence=low
Rice	`Os01g0865600` (OsbHLH149) - identity=37.1; qcov=1.05; evalue=5.08e-148; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF14215 (bHLH-MYC_N); PF23176 (bHLH_LHW)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022183

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057807603.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807603.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057807603.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057807603.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057807603.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:34854354`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:34854447`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A24,B61,C38,C45,C62
`Chr1:34855784`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr1:34855988`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B66
`Chr1:34856085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:34856287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B137,B17,B73,C64,C8
`Chr1:34856371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr1:34856550`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr1:34856790`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:34856840`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr1:34858696`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B7,C1,C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807603.1

884 aa

442

884

bHLH-MYC_N

bHLH_LHW

PF14215 bHLH-MYC_N 5-169 aa PF23176 bHLH_LHW 676-736 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807603.1`	Pfam	`PF14215`	bHLH-MYC_N	Family	5	169	5e-35	122.1	bHLH-MYC and R2R3-MYB transcription factors N-terminal
`XP_057807603.1`	Pfam	`PF23176`	bHLH_LHW	Domain	676	736	2.4e-35	121.0	Transcription factor LHW bHLH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951620.1
AAAAAGGAAATTAAATATAAAAAAAAGGAAAAAAAGAAAAGAAAAGAAAGCAAAAGCAGCACATAAAAACCATCATTCTTCCACACTTCGACCCCATCACACAACCAAAAACTCAAGCTCCTCAATTTTCACACGCCCTTCAGAGTAAACATTCCAACCGGACTTCCTCCCCCTTCCTTCACAAAACACCCTAAAGCTCTGATCTTTTATTCCCTAAACCTAAATTCCAACCAAAAATCAACTGCATTTTACAATGGAGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022183
ATGGGGTATTTGTTGAAAGAGGGTTTGAAGACTCTTTGTGGGGTTAATCAGTGGTCTTATGCTGTTTTCTGGAAGATTGGCTGCCAAAATCCCAAGCTTTTGATTTGGGAAGAATGTTACTACGAGGCTGCAACGTGTCCGGGCCTACCGGGAAAGGAGAATGCAGATGCCAGTCTTCACGACTACAACTCATCTTGGATCTCAGCAGAAGCAGGGGACAAGGTGCATTTGCTCGTGAACAAGATGATGATGGACAGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807603.1
MGYLLKEGLKTLCGVNQWSYAVFWKIGCQNPKLLIWEECYYEAATCPGLPGKENADASLHDYNSSWISAEAGDKVHLLVNKMMMDSHVNIVGEGLVGRVAFTGNHQWILSENYCGDSYPPEVVKEVCQQFSAGMQTVAVVPVLPHGVVQFGSSMAIMENLGFINDVTSLILQLGYVSGALLSPNYEAKEQHAPRIGVPVGNFTSGGLSLEPNTCSFDSFNYVGNPNQFSLAGQIQNELKSSGSAHEASNSNHDGIRHQSY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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