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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001987`

染色体: Chr01 坐标: 35294455-35299334 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001987`
名称	SmilChr01G001987
描述	protein IQ-DOMAIN 5-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	35294455 - 35299334 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022458`
GeneID	`131022458`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022458`
原始查询	`SmilChr01G001987`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein IQ-DOMAIN 5-like
产物	protein IQ-DOMAIN 5-like
Arabidopsis	`AT3G22190` (IQD5) IQ-domain 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821783] identity=40.4; qcov=0.568; evalue=5.85e-53; confidence=medium
Rice	`Os03g0648300` - identity=42.1; qcov=0.431; evalue=1.54e-49; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00612 (IQ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022458

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057807931.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057807931.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057807931.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057807931.1`
5	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057807931.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:35294818`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,C26
`Chr1:35295755`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	B75,C19,D7
`Chr1:35295755`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	B75,C19,D7
`Chr1:35295839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B124
`Chr1:35296630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B46,B84,C85,D9
`Chr1:35296697`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,B71,C45
`Chr1:35296719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B140,B31,B6
`Chr1:35296719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B31,B6
`Chr1:35296850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B135,B66,B72,C49
`Chr1:35297060`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807931.1

585 aa

292

585

PF00612 IQ 235-254 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807931.1`	Pfam	`PF00612`	IQ	Motif	235	254	3.8e-07	30.0	IQ calmodulin-binding motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951948.1
ACATTTTTCTAGTGGATTTTTTTATTTGAATTTTTCCTTTACTCTATTCATTTCCGCAGACGCATACAATCTTTTTCCCTTTTACGTTGTTTCTGGGAAAATTAAAGTGTGCGTTTGTCTTCAAAATTTAGTAATTATTAATAATTTTGACGAGCATCTTCAATTTCATCTTCAGAAATTCTCCAGTGGAAGTTGCATGGATTAAATCACGTATTTTTACTGCTTGGTTTATAAATTCGTGAGAGTTTATTGCAGCTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022458
ATGGGTGCTCCAAGGAGATGGATCAAACAATTGCTTGGTTTGAAGAAATCAGAGAAAATAGTATCTTCGGAGGAGGAAAATAGTTCTGGAAATGTTGGCAAGAGTTGGAACCAAAGCAAGCCCTCTATTGAGCCTGAGAAAGGCAGATATGAAAATGAGTTGAATGAGAATGTGGACACAGAATTTGAAGATGCAAACTGGCAGTGGGAGATGGACCAATCCGGTGGTGCGCCTTCGACATCACTTCAGGCAAAGAACGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807931.1
MGAPRRWIKQLLGLKKSEKIVSSEEENSSGNVGKSWNQSKPSIEPEKGRYENELNENVDTEFEDANWQWEMDQSGGAPSTSLQAKNAAQLSEDPPAVSPRVQNAPQQQPQEDWREEWMGVYAKEGNFKSALDSPNSPEEQSAARLDDDAVEGWATPDVREMFESDPDPISPHSSSLEVEYAALDAEDANFLSALEEDGNMQEESAARCIQTAIRGFLLPNEAPKTDTRLPMSEESAAIRIQTIYRGFMARRAFRAIRGLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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