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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001994`

染色体: Chr01 坐标: 35339808-35341392 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001994`
名称	SmilChr01G001994
描述	protein FAF-like, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	35339808 - 35341392 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022465`
GeneID	`131022465`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022465`
原始查询	`SmilChr01G001994`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAF-like, chloroplastic
产物	protein FAF-like%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G22090` (AT5G22090) FAF-like protein (DUF3049) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832270] identity=33.6; qcov=1.05; evalue=1.05e-50; confidence=low
Rice	`Os03g0705800` - identity=35.6; qcov=0.484; evalue=1.77e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11250 (FAF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022465

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057807944.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057807944.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057807944.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057807944.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057807944.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:35340103`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B110,B131,C47
`Chr1:35340122`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:35340198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr1:35340231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C56
`Chr1:35340881`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,C3
`Chr1:35340949`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	18	A7,B121,B136,B35,B61,B71,B76,B86,B88,B95,B96,C14,C22,C4,C60,C66,D2,D3
`Chr1:35340951`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	18	A7,B121,B136,B35,B61,B71,B76,B86,B88,B95,B96,C14,C22,C4,C60,C66,D2,D3
`Chr1:35341019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B95
`Chr1:35341208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:35341227`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B110,B131,C47
`Chr1:35341227`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B110,B131,C47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057807944.1

430 aa

215

430

FAF

PF11250 FAF 226-276 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057807944.1`	Pfam	`PF11250`	FAF	Family	226	276	4.3e-19	69.1	Fantastic Four meristem regulator

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057951961.1
CGTCTATATATTTGCGAAAATTTGAAAATAAGGAAGTCAATAAGCATGACATAGAATGAAGTTAATAAATGAAGGCCTAATTTACTAATACACACATACTGGGGCCCATGGGATCCATTCGATTCTGCATTTTGGGCTCCCTACAAATACCCCTTCCATCACCAAGTAATCCTCATCAAAAATTCTTGCTCACAACCATCCTTGTCTTGGATGCTGTTGTCTGCTTGAATTTTCAAGCTACTAACGTTGATATGCCTGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022465
ATGGGATCCATTCGATTCTGCATTTTGGGCTCCCTACAAATACCCCTTCCATCACCAAGTAATCCTCATCAAAAATTCTTGCTCACAACCATCCTTGTCTTGGATGCTGTTGTCTGCTTGAATTTTCAAGCTACTAACGTTGATATGCCTGCGAGAAGGAGCCCTAATCACATTCCCTCGGAGTCGGAGGGCATCGTCACCATCCTCGCCGAAACCTGCAAGGCCGGATCCATACGCCGCACTCTCTCCGCCGACATGTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057807944.1
MGSIRFCILGSLQIPLPSPSNPHQKFLLTTILVLDAVVCLNFQATNVDMPARRSPNHIPSESEGIVTILAETCKAGSIRRTLSADMSSKKWLHQNGFFSPIKKIVSSQQIAPNQDQVWSSIQADKDTNDQPPQTTGVWGLILTQKSDTSPPYIPPMLKRSTSSLSDKSLEVCTESLGSETGSDCFSCPTDADDQDTDDQILSQRNEGDPFADLHVVKYKNSPPRPFPPPLPSIAAGASLQMQSHRQNGRLVLEAVSVAPR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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