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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001995`

染色体: Chr01 坐标: 35362481-35367022 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001995`
名称	SmilChr01G001995
描述	uncharacterized SmilChr01G001995
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	35362481 - 35367022 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007086`
GeneID	`131007086`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007086`
原始查询	`SmilChr01G001995`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121]; symbol=AT3G25270; hit=AT3G25270; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121]; symbol=AT3G25270; hit=AT3G25270; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G25270` (AT3G25270) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822121] identity=24.3; qcov=0.852; evalue=3.31e-21; confidence=weak
Rice	`gene-orf258` (orf258) - identity=32.8; qcov=0.312; evalue=4.44e-09; confidence=low
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007086

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057790227.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057790227.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057790227.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790227.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790227.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:35362486`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	14	A18,A5,B128,B2,B30,B36,B38,B49,B75,C56,C59,C60,C78,C84
`Chr1:35362523`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A18,B110,B137,B19,B21,C47
`Chr1:35362532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr1:35362616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B137,B19,B21
`Chr1:35362664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C44,D8
`Chr1:35366131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A4,B114,B121,B129,B2,B22,B38,B60,B67,B76,B80,B85,B87,B97,C53,C56,C72,C75,C8,C83,C84
`Chr1:35366144`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A4,B114,B121,B126,B129,B2,B22,B38,B60,B67,B71,B76,B80,B85,B87,B97,C23,C53,C56,C7,C72,C75,C8,C83,C84,D1
`Chr1:35366155`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,C41,C56,C64
`Chr1:35366264`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B105,B114,D5
`Chr1:35366279`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B121,B32
`Chr1:35366318`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B135,B63,C5,D9
`Chr1:35366336`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B114,C23,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790227.1

372 aa

186

372

zf-RVT

RVT_3

PF13966 zf-RVT 66-137 aa PF13456 RVT_3 242-357 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790227.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	66	137	8.5e-14	52.7	zinc-binding in reverse transcriptase
`XP_057790227.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	242	357	6.5e-15	55.9	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934244.1
ATGTCTCCCGTCAATCAACCGTTCAGAATGTTCAAGATTATCTCCATCGTGGCGACGACCTTCTGTCTCAACAATTCAAGGAATTATGAGCACAGAATCGAGAGATCTTTGACTTCCTACACGGTCAATATGATCGACCCTATGCAGAACATCATCAAGGACGTTTCCGATTCGAGGACGAATCGTTTCAAGGATGGAGAGAATGATGAAGATAGAATTTGGATTTGGGGGTTGGATGTTATTCCTAAAGTGAAGCTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007086
ATGTCTCCCGTCAATCAACCGTTCAGAATGTTCAAGATTATCTCCATCGTGGCGACGACCTTCTGTCTCAACAATTCAAGGAATTATGAGCACAGAATCGAGAGATCTTTGACTTCCTACACGGTCAATATGATCGACCCTATGCAGAACATCATCAAGGACGTTTCCGATTCGAGGACGAATCGTTTCAAGGATGGAGAGAATGATGAAGATAGAATTTGGATTTGGGGGTTGGATGTTATTCCTAAAGTGAAGCTCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790227.1
MSPVNQPFRMFKIISIVATTFCLNNSRNYEHRIERSLTSYTVNMIDPMQNIIKDVSDSRTNRFKDGENDEDRIWIWGLDVIPKVKLFLWRCLVNALPTSEGLRRCSIDVDPICRRCGEAIETGEHALRDCNWVAFLWEVSPLKLKTVDAQNSSNLSHWIDEFRKNNHRESHTIFAIVLWTIWYSRNQLLFNEKEFSHVDCLRIASRAVWTKPVSSQPPQSMPIASVCCRQGQVLLWCGAALNEQEGLDFGVIMKDADGCL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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