当前解析结果
SmilChr01G002009| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002009 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002009 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002009 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 35634152 - 35635381 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131007126 |
|---|---|
| GeneID | 131007126 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007126 |
| 原始查询 | SmilChr01G002009 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT2G13770 (AT2G13770)nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=55.2; qcov=0.38; evalue=5.98e-34; confidence=low |
| Rice | Os06g0597250- identity=47.3; qcov=1.02; evalue=3.2e-121; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007126 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057790274.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.20000 | XP_057790274.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790274.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057790274.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057790274.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057790274.1PF28509
DUF8418 35-74 aa
PF04827
Plant_tran 142-309 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057790274.1 |
Pfam | PF28509 |
DUF8418 | Domain | 35 | 74 | 2.2e-19 | 69.7 | Domain of unknown function (DUF8418) |
XP_057790274.1 |
Pfam | PF04827 |
Plant_tran | Family | 142 | 309 | 7.8e-73 | 245.2 | Plant transposon protein |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。