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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002019`

染色体: Chr01 坐标: 35768220-35772448 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002019`
名称	SmilChr01G002019
描述	endoplasmic reticulum oxidoreductin-1-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	35768220 - 35772448 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022793`
GeneID	`131022793`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022793`
原始查询	`SmilChr01G002019`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	endoplasmic reticulum oxidoreductin-1-like
产物	endoplasmic reticulum oxidoreductin-1-like
Arabidopsis	`AT1G72280` (ERO1) endoplasmic reticulum oxidoreductins 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843560] identity=78.4; qcov=0.834; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0733800` (ERO1) - identity=79; qcov=0.813; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0015035 (protein-disulfide reductase activity); GO:0016972 (thiol oxidase activity); GO:0034975 (protein folding in endoplasmic reticulum); GO:0071949 (FAD binding)
KEGG	smil04141 (Protein processing in endoplasmic reticulum - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04137 (ERO1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022793

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057808303.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057808303.1`
3	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.20000	`XP_057808322.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808303.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808303.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:35768808`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A4,B99
`Chr1:35769022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D9
`Chr1:35769345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B68,C2
`Chr1:35769345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B68,C2
`Chr1:35769375`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	19	A11,A20,B11,B127,B138,B2,B26,B30,B46,B59,B70,B75,B81,B9,C1,C13,C19,C20,D9
`Chr1:35769458`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A16
`Chr1:35769460`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	19	A11,A20,B11,B127,B138,B2,B26,B30,B46,B59,B70,B75,B81,B9,C1,C13,C19,C20,D9
`Chr1:35769705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr1:35769996`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B138,B15,B17,B41,C70
`Chr1:35771534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	D10,D9
`Chr1:35771534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D9
`Chr1:35771558`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808303.1

479 aa

240

479

ERO1

PF04137 ERO1 85-436 aa

XP_057808309.1

477 aa

238

477

ERO1

PF04137 ERO1 85-434 aa

XP_057808314.1

475 aa

238

475

ERO1

PF04137 ERO1 85-432 aa

XP_057808322.1

427 aa

214

427

ERO1

PF04137 ERO1 85-407 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808303.1`	Pfam	`PF04137`	ERO1	Family	85	436	5.6e-116	388.3	Endoplasmic Reticulum Oxidoreductin 1 (ERO1)
`XP_057808309.1`	Pfam	`PF04137`	ERO1	Family	85	434	9.4e-117	390.8	Endoplasmic Reticulum Oxidoreductin 1 (ERO1)
`XP_057808314.1`	Pfam	`PF04137`	ERO1	Family	85	432	1.5e-115	386.8	Endoplasmic Reticulum Oxidoreductin 1 (ERO1)
`XP_057808322.1`	Pfam	`PF04137`	ERO1	Family	85	407	1e-106	357.8	Endoplasmic Reticulum Oxidoreductin 1 (ERO1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952331.1
ATGGCCGAAGCTAAAGCTGTTGATGGTGGTAAGAAAAAACAGTTGAAGAAATTCAAAGAGGGAAAAGGTGGAATGAGGAAATTGGCAGCAATTGGGGCAGCTTTGGTGGTGGTGGTAGCCATCGCTATAACGTACAATCATGCTCAAATTCACAAGTCTTGCCATTGTTCTCAGGATGCTCGTAAGTATACTGGCATTGTTGAGGACTGCTGCTGTGATTATGAGACGGTGGATGGTGTTAATGGGGCTGTACTGTACCC...

XM_057952326.1
ATGGCCGAAGCTAAAGCTGTTGATGGTGGTAAGAAAAAACAGTTGAAGAAATTCAAAGAGGGAAAAGGTGGAATGAGGAAATTGGCAGCAATTGGGGCAGCTTTGGTGGTGGTGGTAGCCATCGCTATAACGTACAATCATGCTCAAATTCACAAGTCTTGCCATTGTTCTCAGGATGCTCGTAAGTATACTGGCATTGTTGAGGACTGCTGCTGTGATTATGAGACGGTGGATGGTGTTAATGGGGCTGTACTGTACCC...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131022793
ATGGCCGAAGCTAAAGCTGTTGATGGTGGTAAGAAAAAACAGTTGAAGAAATTCAAAGAGGGAAAAGGTGGAATGAGGAAATTGGCAGCAATTGGGGCAGCTTTGGTGGTGGTGGTAGCCATCGCTATAACGTACAATCATGCTCAAATTCACAAGTCTTGCCATTGTTCTCAGGATGCTCGTAAGTATACTGGCATTGTTGAGGACTGCTGCTGTGATTATGAGACGGTGGATGGTGTTAATGGGGCTGTACTGTACCC...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057808303.1
MAEAKAVDGGKKKQLKKFKEGKGGMRKLAAIGAALVVVVAIAITYNHAQIHKSCHCSQDARKYTGIVEDCCCDYETVDGVNGAVLYPLLQDLVRTPFFRYFKVKLRCDCPFWPDDGMCKLRDCSVCECPENEFPEPFKRPIQYGLPSDDLKCQEGKPQAAVNRTLDSKAFRGGWIEVDNPWTLDDMTDNSEMTYVNLQLNPERYTGYTGPSATRIWDAIYSENCPKYPSGEICQEKKVLYKLISGLHSSISIHIAADYLV...

XP_057808309.1
MAEAKAVDGGKKKQLKKFKEGKGGMRKLAAIGAALVVVVAIAITYNHAQIHKSCHCSQDARKYTGIVEDCCCDYETVDGVNGAVLYPLLQDLVRTPFFRYFKVKLRCDCPFWPDDGMCKLRDCSVCECPENEFPEPFKRPIQYGLPSDDLKCQEGKPQAAVNRTLDSKAFRGGWIEVDNPWTLDDMTDNSEMTYVNLQLNPERYTGYTGPSATRIWDAIYSENCPKYPSGEICQEKKVLYKLISGLHSSISIHIAADYLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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