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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002021`

染色体: Chr01 坐标: 35776997-35777928 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002021`
名称	SmilChr01G002021
描述	uncharacterized SmilChr01G002021
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	35776997 - 35777928 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022875`
GeneID	`131022875`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022875`
原始查询	`SmilChr01G002021`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	stomagen [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826909]; symbol=STOMAGEN; hit=AT4G12970; species=arabidopsis; confidence=low
产物	stomagen [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826909]; symbol=STOMAGEN; hit=AT4G12970; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G12970` (STOMAGEN) stomagen [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:826909] identity=86.5; qcov=0.394; evalue=1.52e-30; confidence=low
Rice	`Os01g0914400` (STOMAGEN) - identity=84; qcov=0.379; evalue=9.8e-28; confidence=low
GO	GO:2000123 (positive regulation of stomatal complex development)
KEGG	-
Pfam	PF16851 (Stomagen)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022875

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057808406.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808406.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808406.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808406.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808406.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:35777491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C34
`Chr1:35777700`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B125,C56
`Chr1:35777789`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B113,B119,B127,B34,C12
`Chr1:35777789`	`CAT`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B113,B119,B127,B34,C12
`Chr1:35777791`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	27	A1,A21,A25,B129,B137,B19,B21,B33,B58,B74,B78,B8,B80,B9,B93,B94,C21,C22,C28,C32,C38,C48,C55,C71,C81,C87,D3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808406.1

127 aa

127

Stomagen

PF16851 Stomagen 78-126 aa

XP_057808410.1

132 aa

132

Stomagen

PF16851 Stomagen 83-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808406.1`	Pfam	`PF16851`	Stomagen	Domain	78	126	1.3e-32	112.3	Stomagen
`XP_057808410.1`	Pfam	`PF16851`	Stomagen	Domain	83	131	1.4e-32	112.1	Stomagen

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952427.1
AAGATACTGTATAAGATTTTGTAGGTCTCTGGAAATGGAATGATCCAGCAATTTGTTATTTGAAAATGTAGTTTTGTCTGTTTTTGTCTTTGCAGTAGTACTACTACATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTATATGGTCAGTATTCATTCATATTTACATTCTTCACATCCTTTCTCTTCTCCAAACACTTTACCACTACGATTATGGAGAAGCGTTTGCTCCTCCTTGGCTTGCTCTGTGCAGCACTTCTACTCC...

XM_057952423.1
GAAATGGAATGATCCAGCAATTTGTTATTTGAAAATGTAGTTTTGTCTGTTTTTGTCTTTGCAGTAGTACTACTACATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTATATGGTCAGTATTCATTCATATTTACATTCTTCACATCCTTTCTCTTCTCCAAACACTTTACCACTACGATTATGGAGAAGCGTTTGCTCCTCCTTGGCTTGCTCTGTGCAGCACTTCTACTCCTAGTTCAAGATGCCACAGGGTCCAGAGTTCA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131022875
ATGTGTGTGTGTGTATATGGTCAGTATTCATTCATATTTACATTCTTCACATCCTTTCTCTTCTCCAAACACTTTACCACTACGATTATGGAGAAGCGTTTGCTCCTCCTTGGCTTGCTCTGTGCAGCACTTCTACTCCTAGTTCAAGATGCCACAGGGTCCAGAGTTCAAATGGCACATCTCAGAAACTGGAAAGATGACCATATTCCATCAGCAGACAGAGAACAAAGTTCTAGAAGATTCTTGATCGGCTCAGTAGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057808406.1
MCVCVYGQYSFIFTFFTSFLFSKHFTTTIMEKRLLLLGLLCAALLLLVQDATGSRVQMAHLRNWKDDHIPSADREQSSRRFLIGSVAPTCTYNECRGCRFKCRAEQVPVEGNDPINSAYHYKCVCHR

XP_057808410.1
MCVCVYGQYSFIFTFFTSFLFSKHFTTTIMEKRLLLLGLLCAALLLLVQDATGSRVQMAHLRNWKDDHIPSADRELWEMQQSSRRFLIGSVAPTCTYNECRGCRFKCRAEQVPVEGNDPINSAYHYKCVCHR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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