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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002036`

染色体: Chr01 坐标: 35998437-36001209 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002036`
名称	SmilChr01G002036
描述	RGG repeats nuclear RNA binding protein C-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	35998437 - 36001209 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022923`
GeneID	`131022923`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022923`
原始查询	`SmilChr01G002036`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RGG repeats nuclear RNA binding protein C-like
产物	RGG repeats nuclear RNA binding protein C-like
Arabidopsis	`AT5G47210` (AT5G47210) Hyaluronan / mRNA binding family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834767] identity=45.8; qcov=0.192; evalue=5.8e-07; confidence=weak
Rice	`Os01g0603000` - identity=45; qcov=0.16; evalue=1.08e-07; confidence=weak
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022923

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057808448.1`
2	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.40000	`XP_057808448.1`
3	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	Cytoplasmic ribonucleoprotein granule	0.40000	`XP_057808448.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057808448.1`
5	P-body	P-body	0.20000	`XP_057808448.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:35999902`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B95,C34
`Chr1:35999964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A1,B89,B99
`Chr1:35999991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr1:36000030`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr1:36000033`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B105,B75
`Chr1:36000444`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	129	A1,A10,A11,A13,A14,A2,A20,A21,A22,A3,A4,A7,A9,B10,B100,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B110,B112,B113,B114,B115,B119,B12,B121,B122,B125,B13,B130,B133,B134,B136,B15,B18,B20,B24,B25,B27,B28,B29,B30,B32,B33,B34,B37,B41,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B55,B56,B57,B62,B63,B65,B68,B69,B70,B72,B73,B76,B78,B85,B86,B87,B89,B90,B91,B92,B95,B96,B97,B99,C10,C11,C12,C13,C15,C17,C18,C19,C2,C20,C23,C24,C27,C28,C3,C33,C39,C40,C41,C43,C45,C47,C50,C51,C52,C54,C56,C57,C61,C63,C69,C7,C71,C72,C75,C76,C79,C8,C83,C85,C86,C87,C9,D4,D5,D6,D7
`Chr1:36000449`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	125	A1,A10,A11,A13,A14,A2,A20,A21,A22,A3,A4,A7,A9,B10,B100,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B110,B112,B113,B114,B115,B119,B12,B121,B122,B125,B13,B130,B133,B134,B136,B15,B18,B20,B24,B25,B27,B28,B29,B30,B33,B34,B37,B41,B44,B45,B46,B47,B48,B5,B50,B51,B55,B56,B57,B62,B63,B65,B68,B69,B70,B72,B76,B78,B85,B87,B89,B90,B91,B92,B95,B96,B97,B99,C10,C11,C12,C13,C17,C18,C19,C2,C20,C23,C24,C27,C28,C3,C33,C39,C40,C41,C43,C45,C47,C50,C51,C52,C54,C56,C57,C61,C63,C69,C7,C71,C72,C75,C76,C79,C8,C83,C85,C86,C87,C9,D4,D5,D6,D7
`Chr1:36000601`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B125,B85,B87,C41
`Chr1:36000969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952465.1
GAATGGAAGGCTAGTATTTATCTTGATTTTGCGTGATGACAAAGGCTTTATTTTTATAAATCACATAATAATATTTGTAGGGTTTAGATTCGTCAATCTCAAAAGATTATATAGGGTTTAATCTAATCGCAGACATTTCAGTTGGATCGACTCTTCTCTCTATTTTCGTCGACGTCAATGGCGTTTAATGGCAACGCCTTTGCGCCATTAGAAGTTGACGACGTCGAAAATCTACTAGCTCACGTTTCGACCGTCACCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022923
ATGGCGTTTAATGGCAACGCCTTTGCGCCATTAGAAGTTGACGACGTCGAAAATCTACTAGCTCACGTTTCGACCGTCACCGTCAAATCAGGTGTGCCGCCATCCGCGGTGGATAAACGGAACGATAAGAAGGCGGCCTTCGCTTCATCTCACTCTTCTTCAGTGCCTAATGAAAAGTTGAGCATTAACAATAGGAAGGGCCAAAATAACAGAAACAGAGTAAACGAGAGGATAAACGACACACGACAAAACAGAAATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808448.1
MAFNGNAFAPLEVDDVENLLAHVSTVTVKSGVPPSAVDKRNDKKAAFASSHSSSVPNEKLSINNRKGQNNRNRVNERINDTRQNRNGGNVNNCVGIERQNRVNPNNSRKPAAFRSNNGSKKATNGNCSGHEEVIEEEEGWQIVRRSRSKDYKQSNANQSRPSTDVNVACKEEEVKVSDDKQHHEENGGDGEKLNGGVQVADEARVEGDEALVKQDKVLVKKEETERLQLEAKKSAELEAKKKELEAKKMTLKQYEKLLEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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