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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002047`

染色体: Chr01 坐标: 36242712-36244837 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002047`
名称	SmilChr01G002047
描述	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g25290-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	36242712 - 36244837 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131022984`
GeneID	`131022984`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131022984`
原始查询	`SmilChr01G002047`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g25290-like
产物	cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g25290-like
Arabidopsis	`AT3G25290` (AT3G25290) Auxin-responsive family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822123] identity=57.9; qcov=0.964; evalue=4.06e-150; confidence=high
Rice	`Os08g0524200` (OJ1191_A10.101) - identity=50.7; qcov=0.911; evalue=2.59e-123; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03188 (Cytochrom_B561); PF04526 (DUF568)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131022984

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057808509.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808509.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808509.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808509.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808509.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:36242972`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr1:36243519`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B103,C41
`Chr1:36243519`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B103,C41
`Chr1:36243522`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B103,C41
`Chr1:36243522`	`TAG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B103,C41
`Chr1:36243685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr1:36244091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B48,B75,B84,C60
`Chr1:36244097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr1:36244111`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808509.1

394 aa

197

394

DUF568

Cytochrom_B561

PF04526 DUF568 89-188 aa PF03188 Cytochrom_B561 209-333 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808509.1`	Pfam	`PF04526`	DUF568	Family	89	188	3.9e-33	114.9	Protein of unknown function (DUF568)
`XP_057808509.1`	Pfam	`PF03188`	Cytochrom_B561	Family	209	333	2.5e-06	28.5	Eukaryotic cytochrome b561

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952526.1
TGGAGTATTATATTCTTCAATAAAAAACACAAAATATCCCCTCCACAATTCCTCCCCCAATTTAAACACGAACCCAAACACTACACTTTCAGAGTTTCACTCCACACACTCTCTCTCTCTCTCTAAAATTCACCCCCACCATTTTCACCTCTGCATTCTCCTCCACTAATGGCACCTCCACTCCTAACCGCACTCCTCCTTCTCCTCCTCGCCTCGCTAATACCAGCATCACAGTCGCAGGCGGCCACGTGTTTATCGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131022984
ATGGCACCTCCACTCCTAACCGCACTCCTCCTTCTCCTCCTCGCCTCGCTAATACCAGCATCACAGTCGCAGGCGGCCACGTGTTTATCGCAGAGCTTCACGAGCAACAAGCGCTACACCTTCTGCAACGATCTCCCCTCCCTCAACGCCTATCTCCACTGGGACTTCAATGAGGCCCAATCCACCCTCTCCGTCGCCTTCATCGCCCCCCCGGCTCAGCCCGACGGCTGGATTTCCTGGGCCCTCAACCCCACCGCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808509.1
MAPPLLTALLLLLLASLIPASQSQAATCLSQSFTSNKRYTFCNDLPSLNAYLHWDFNEAQSTLSVAFIAPPAQPDGWISWALNPTASGMAGSQALIAFKQPDGKMAVKTYNITSYQPLKESKVWFDVKESSAESSGGTIKLFATVVLPEKGRTVLNHVWQVGSSVTGGVPDKHAFQPANLNSKGSLDLLKGQSTASAGGNSNLKKRNIHGVLNVVSWGIMFPTGIIIARYLKVFPSADPAWFYLHVSCQVSAYAIGVAGW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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