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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002051`

染色体: Chr01 坐标: 36319100-36320150 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002051`
名称	SmilChr01G002051
描述	cysteine-rich repeat secretory protein 55-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	36319100 - 36320150 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023019`
GeneID	`131023019`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023019`
原始查询	`SmilChr01G002051`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cysteine-rich repeat secretory protein 55-like
产物	cysteine-rich repeat secretory protein 55-like
Arabidopsis	`AT5G48540` (AT5G48540) receptor-like protein kinase-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834910] identity=50.4; qcov=0.977; evalue=1.5e-82; confidence=high
Rice	`Os03g0277700` - identity=44.3; qcov=0.988; evalue=1.82e-71; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01657 (Stress-antifung)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023019

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057808541.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.40000	`XP_057808541.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057808541.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808541.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808541.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:36319553`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	B105,B119,B12,B124,B133,B19,B29,B33,B34,B72,B78,B93,B94,C28,C38,C49,C55,C73,C74,C87,D3
`Chr1:36319616`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B51
`Chr1:36319616`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B51
`Chr1:36319621`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B115
`Chr1:36319693`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:36319813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C83
`Chr1:36319989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808541.1

256 aa

128

256

Stress-antifung

PF01657 Stress-antifung 29-117 aa PF01657 Stress-antifung 134-227 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808541.1`	Pfam	`PF01657`	Stress-antifung	Family	29	117	1.2e-33	116.4	Salt stress response/antifungal
`XP_057808541.1`	Pfam	`PF01657`	Stress-antifung	Family	134	227	1.2e-33	116.4	Salt stress response/antifungal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952558.1
TAAGTGGGAAACTTCCAATAATTGAAATCTGTTTCTCACATTTTGGATTGCATTGACTTTTGTCATTCTTTCTAGAGCACTTGTTCATTTTCAACAAAATCTCCTCACATAGGCATGCATATCTACACTAGTATAAAAAATCCCAAGCCATGATGAGATTCTTTCATCACAGCCATGGATCTCCTATCCATTCCCCTCCTCATCACCCTCTCTCTCCACATTCTCGCAGCAGAATCTTCCGATCCCGCCGCGAATCTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023019
ATGGATCTCCTATCCATTCCCCTCCTCATCACCCTCTCTCTCCACATTCTCGCAGCAGAATCTTCCGATCCCGCCGCGAATCTCTGCAACGGCAACAGCAGAGCCAACGCCACAACATCAAGAAGCATAGACACCTTACTGCCCAAGCTAGTCTCCGGCACCATCGAAAGCGGCTTCATCGCCACCTCCTACGGCGGGGTCCACGGCCTAGCCCAATGCAGAGGCGACGTCAGCAGCAGCGACTGCGCCTCCTGCATCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808541.1
MDLLSIPLLITLSLHILAAESSDPAANLCNGNSRANATTSRSIDTLLPKLVSGTIESGFIATSYGGVHGLAQCRGDVSSSDCASCIQDAAKEVRTLCPSQSDARIWYDFCFLRYTTYKFFGEVDTSGIFLINTQNVSDPKAFNKKLSSLMDEISSEAVRSSSMGLGRGKREVSEFIKLYALVQCTRDLSELNCAQCVSIAVSNFPTVCGDRRGCRVLYGSCYVRYELYPFFFPLDSLESLGSSSEEKYERVMAVKN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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