当前解析结果
SmilChr01G002054| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002054 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002054 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002054 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 36328002 - 36330605 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131023051 |
|---|---|
| GeneID | 131023051 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023051 |
| 原始查询 | SmilChr01G002054 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os01g0264500; species=rice; confidence=high |
| 产物 | hit=Os01g0264500; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | AT5G18250 (AT5G18250)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831943] identity=73.8; qcov=0.829; evalue=2.45e-55; confidence=high |
| Rice | Os01g0264500- identity=76; qcov=0.806; evalue=4.62e-57; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023051 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 1.00000 | XP_057808579.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 1.00000 | XP_057808588.1 |
| 3 | Mitochondrion outer membrane | 线粒体外膜 | 0.20000 | XP_057808579.1 |
| 4 | Chloroplast | 叶绿体 | 0.20000 | XP_057808579.1 |
| 5 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.20000 | XP_057808579.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:36328386 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A16 |
Chr1:36328637 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C23,C61 |
Chr1:36330033 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,B12,B121,B122,B136 |
Chr1:36330163 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D10 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
3 records
下载 cDNA FASTA3 records
下载 CDS FASTA3 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。