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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002064`

染色体: Chr01 坐标: 36495443-36497974 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002064`
名称	SmilChr01G002064
描述	ninja-family protein AFP2-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	36495443 - 36497974 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023109`
GeneID	`131023109`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023109`
原始查询	`SmilChr01G002064`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ninja-family protein AFP2-like
产物	ninja-family protein AFP2-like
Arabidopsis	`AT3G07255` (AT3G07255) nuclear transport factor 2/RNA recognition motif protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28718981] identity=60.5; qcov=0.238; evalue=7.58e-32; confidence=weak
Rice	`Os07g0602900` - identity=68.2; qcov=0.182; evalue=3.97e-24; confidence=weak
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0007165 (signal transduction); GO:0045892 (negative regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF16135 (TDBD)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023109

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057808638.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057808638.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057808638.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057808638.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057808638.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:36495657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr1:36495735`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr1:36495777`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B2,B8,C19,C83
`Chr1:36495779`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B14,B38,B39,C54
`Chr1:36495779`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B14,B38,B39,C54
`Chr1:36495798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,C1,C20
`Chr1:36495916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,C30,D10
`Chr1:36495931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C30
`Chr1:36496084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr1:36496090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,C14,C4,C49,C74
`Chr1:36496101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C54,C87
`Chr1:36496112`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057808638.1

362 aa

181

362

TDBD

PF16135 TDBD 322-355 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057808638.1`	Pfam	`PF16135`	TDBD	Domain	322	355	2.4e-07	31.3	Tify domain binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057952655.1
GGAATCTTTAGATTTTGTAGGACATTACAATAGCCGCTAATTTACGGATTTGAAGCTAAATCCGCACTTAACTCCGAACCTCTTCCGAACCTAATTACGAACTTTTTCTCTTCTTGCGTGTCAACAACCACCCTCTCCACTTCTCTCATCCCTCCACGTGGCAGAAGCCCGTTTATTCTCTCTCTTCTCTCTGCGTTGGTCTCTTTCTCTAACCATTCAAACCTAGTCCAAACACAAGAACAAAATAAGCAAACAAGCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023109
ATGGGGCGAGAATTTCCCACAATGGAAGACGAATTCGAGCTCAGTTTGGAGCTCTCCATCGGCGGTTGCTACGCCAAATCAGAACCCACGAGTTTAGAGAGAGAAAATTCGAGATCTGATTTTTCCTGCGACAAAGCCAAATTCGACGCTGCTGCGGCGGAGAATGGCTGCGAGTTTTCCGATCTGCAGAGGAGGAGAGAGATGCAGGCGATGAAGAGGAGGGAAGCTCGGATGAAGAGAGGATTCAAGAAACCGAGGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057808638.1
MGREFPTMEDEFELSLELSIGGCYAKSEPTSLERENSRSDFSCDKAKFDAAAAENGCEFSDLQRRREMQAMKRREARMKRGFKKPRGLINGGGFIEEDRVAAEAQQQLHGGAGEEPPRKREKSFFGENKVSWGDYGRQQAQFLLPVACPWVAPAGERDERNSGGETPGNAAASSPAVSHHPSTSQKGGSSSDTGSHSSSFATRHNDKVEANSSTSPPRRCIGSTSHEQSTKVAAVSPTIQSDTSKTGQGSTICAQSNLTD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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