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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002078`

染色体: Chr01 坐标: 36740475-36742331 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002078`
名称	SmilChr01G002078
描述	uncharacterized SmilChr01G002078
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	36740475 - 36742331 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007355`
GeneID	`131007355`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007355`
原始查询	`SmilChr01G002078`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=23.2; qcov=0.997; evalue=3.63e-41; confidence=weak
Rice	`Os12g0597300` - identity=27.3; qcov=0.592; evalue=2.2e-32; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007355

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057790446.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057790446.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057790446.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057790446.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057790446.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:36740480`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B86,B9,C6,C75
`Chr1:36740492`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C48
`Chr1:36740493`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B69,B95
`Chr1:36740501`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C16
`Chr1:36740511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B14,B69,C66
`Chr1:36740511`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B69,C66
`Chr1:36740516`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A14,A24,B106,B123,B21,B40,B66,D5
`Chr1:36740571`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B21
`Chr1:36740584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr1:36740585`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B113,B2,B52,C37
`Chr1:36740598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr1:36740640`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790446.1

618 aa

309

618

Transposase_mut

MULE

PF00872 Transposase_mut 427-527 aa PF10551 MULE 428-522 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790446.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	427	527	6.4e-11	42.5	Transposase, Mutator family
`XP_057790446.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	428	522	6.2e-21	75.3	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934463.1
ATGTCGTTTCAAGCAATCGTTATACGGCACAGTGGTCAGTGGAAATTAACCGAGTATGAAGGAGGCGATGAGGTTGTCGTGTACATGTCTAAGGAAGACCTTTGTCATGCGAAGTTGATGCAAGAGGTGCACAATCAATTAAACGAGGATGGTCGATCCACTTATATGCTTTTCTACACATCGACCACGGACGAAGGGCGAAGAATAAAAGTGGCTTTGAAGACTGATTCGGATTTGAACCGGCTGATTTCCGAGCATAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007355
ATGTCGTTTCAAGCAATCGTTATACGGCACAGTGGTCAGTGGAAATTAACCGAGTATGAAGGAGGCGATGAGGTTGTCGTGTACATGTCTAAGGAAGACCTTTGTCATGCGAAGTTGATGCAAGAGGTGCACAATCAATTAAACGAGGATGGTCGATCCACTTATATGCTTTTCTACACATCGACCACGGACGAAGGGCGAAGAATAAAAGTGGCTTTGAAGACTGATTCGGATTTGAACCGGCTGATTTCCGAGCATAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790446.1
MSFQAIVIRHSGQWKLTEYEGGDEVVVYMSKEDLCHAKLMQEVHNQLNEDGRSTYMLFYTSTTDEGRRIKVALKTDSDLNRLISEHKKYPVVYVIEKGKQSAAPVPQTQERVYYEGQRSTVFPIETDVGRSIPTHDDSRDDSSSQEEEDESESSDEEEEATRRIEILDSVSTEQEAWRQTGPQNFTSDDHPDVEPRVGVQQLEARDWGIPVLDFDDAPTLGWEDCNVLESGILSVGALFRSKDDLAIVVGLYHMENHVEY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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