当前解析结果
SmilChr01G002081| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002081 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002081 |
| 描述 | cyclin-C1-2-like |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 36756369 - 36761002 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023212 |
|---|---|
| GeneID | 131023212 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023212 |
| 原始查询 | SmilChr01G002081 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | cyclin-C1-2-like |
| 产物 | cyclin-C1-2-like |
| Arabidopsis | AT5G48630 (AT5G48630)Cyclin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834920] identity=72.4; qcov=1; evalue=2e-137; confidence=high |
| Rice | Os09g0504400 (OsCycC_1)- identity=72.4; qcov=1.02; evalue=7.17e-134; confidence=high |
| GO | GO:0005634 (nucleus); GO:0016538 (cyclin-dependent protein serine/threonine kinase regulator activity); GO:0016592 (mediator complex); GO:0045944 (positive regulation of transcription by RNA polymerase II) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00134 (Cyclin_N) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023212 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808739.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057808739.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057808739.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057808739.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808739.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057808739.1PF00134
Cyclin_N 45-142 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057808739.1 |
Pfam | PF00134 |
Cyclin_N | Domain | 45 | 142 | 1.6e-19 | 70.6 | Cyclin, N-terminal domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。