当前解析结果
SmilChr01G002087| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002087 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002087 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002087 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 36856404 - 36857548 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131023301 |
|---|---|
| GeneID | 131023301 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131023301 |
| 原始查询 | SmilChr01G002087 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131023301 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057808833.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057808833.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057808833.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057808833.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057808833.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:36856413 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B75,C13,C16,C58,D4 |
Chr1:36856418 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C86,D3 |
Chr1:36856426 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A7,C16,C58 |
Chr1:36856436 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B13,B20,B52,B59 |
Chr1:36856482 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B35 |
Chr1:36856486 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,D11 |
Chr1:36856490 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr1:36856505 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A10,B101,B115,B126,B89 |
Chr1:36856507 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C46 |
Chr1:36856523 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A24,B23,B63,C65 |
Chr1:36856526 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 79 | A14,A18,A19,A21,A3,A4,A6,A7,B10,B100,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B113,B114,B119,B120,B126,B127,B135,B19,B21,B22,B24,B26,B27,B29,B3,B34,B36,B39,B40,B45,B48,B5,B56,B7,B8,B81,B83,B84,B94,B95,B96,B97,C12,C13,C18,C23,C26,C28,C29,C3,C31,C38,C40,C42,C50,C56,C61,C63,C73,C78,C8,C82,C83,C85,C9,D1,D11,D2,D7,D8,D9 |
Chr1:36856531 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C43,C80 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。