当前解析结果
SmilChr01G002088| 统一新 Gene ID | SmilChr01G002088 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G002088 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G002088 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 36861484 - 36862224 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131007433 |
|---|---|
| GeneID | 131007433 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131007433 |
| 原始查询 | SmilChr01G002088 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0439900- identity=25.4; qcov=0.801; evalue=1.34e-14; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131007433 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057790448.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.80000 | XP_057790448.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057790448.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057790448.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057790448.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:36861492 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C15,C69 |
Chr1:36861561 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr1:36861569 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B91 |
Chr1:36861625 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D9 |
Chr1:36861937 |
TC |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | C64 |
Chr1:36861937 |
TC |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 1 | C64 |
Chr1:36861982 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C64,C66 |
Chr1:36862075 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C87 |
Chr1:36862086 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A5,B107 |
Chr1:36862091 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B12,C13 |
Chr1:36862091 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B12,C13 |
Chr1:36862114 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A14,A9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。