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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G002091`

染色体: Chr01 坐标: 36937828-36939277 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G002091`
名称	SmilChr01G002091
描述	protein PAM68, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	36937828 - 36939277 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131007494`
GeneID	`131007494`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131007494`
原始查询	`SmilChr01G002091`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein PAM68, chloroplastic-like
产物	protein PAM68%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G19100` (PAM68) PAM68-like protein (DUF3464) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:2745715] identity=75.8; qcov=0.757; evalue=1.63e-68; confidence=high
Rice	`Os06g0319800` - identity=69; qcov=0.495; evalue=7.29e-49; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF11947 (DUF3464)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131007494

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057790450.1`
2	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.80000	`XP_057790450.1`
3	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057790450.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.60000	`XP_057790450.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057790450.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:36937832`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr1:36937833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B79
`Chr1:36937843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B42,B94
`Chr1:36937843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B94
`Chr1:36937874`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B79
`Chr1:36937874`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B79
`Chr1:36938041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:36938062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C56
`Chr1:36938123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:36938131`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B55
`Chr1:36938239`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr1:36938281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B120,B132,B3

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057790450.1

202 aa

101

202

DUF3464

PF11947 DUF3464 53-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057790450.1`	Pfam	`PF11947`	DUF3464	Family	53	182	4.6e-50	170.0	Photosynthesis affected mutant 68

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057934467.1
ATGCCCGCGGAGTCCCAGCACCCGCTGGAAACCCAGCGATCGTTGAGTTCCAGCGAGCGCTCGCTGTTGGGTACGTTGAAGGCATACTCCCACCACTCAATCCACCTCAATCCAATCTCAGCCACTCTAAATTCGCCCAAAGGCTTTGGACCCGCCCCAAAGAAAGCGAGCAAATCCAAGAAACCAAACAAGAAATATGAAAGCGAAGACGAAGACGAAGAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAAATGAGAGAGAAGAAGGCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131007494
ATGCCCGCGGAGTCCCAGCACCCGCTGGAAACCCAGCGATCGTTGAGTTCCAGCGAGCGCTCGCTGTTGGGTACGTTGAAGGCATACTCCCACCACTCAATCCACCTCAATCCAATCTCAGCCACTCTAAATTCGCCCAAAGGCTTTGGACCCGCCCCAAAGAAAGCGAGCAAATCCAAGAAACCAAACAAGAAATATGAAAGCGAAGACGAAGACGAAGAAGAGGAAGAAGAAGAAGAAAATGAGAGAGAAGAAGGCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057790450.1
MPAESQHPLETQRSLSSSERSLLGTLKAYSHHSIHLNPISATLNSPKGFGPAPKKASKSKKPNKKYESEDEDEEEEEEEENEREEGVIPEIVTNRMMSRMGLSVGIPLFIGLLFFPFFYYIKVGLKIDVPTWVPFIVSFVFFGTALLGVSYGIVSANWDPLREGSLLGWTEAKKNWPVFWQSIWGGNKLTDGGDWLKNHGEL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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